Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PCOLCEQ15113 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.4 ms