Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HERC3Q15034 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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