Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP1A4Q13733 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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