Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BNIP1Q12981 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
BNIP1Q12981 ANKMY1-206ENST00000401804 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BNIP1Q12981 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BNIP1Q12981 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
BNIP1Q12981 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BNIP1Q12981 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BNIP1Q12981 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BNIP1Q12981 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BNIP1Q12981 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BNIP1Q12981 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BNIP1Q12981 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BNIP1Q12981 LINC01792-201ENST00000452787 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BNIP1Q12981 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
BNIP1Q12981 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BNIP1Q12981 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
BNIP1Q12981 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BNIP1Q12981 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
BNIP1Q12981 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
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BNIP1Q12981 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BNIP1Q12981 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BNIP1Q12981 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.06■□□□□ 0
BNIP1Q12981 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BNIP1Q12981 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.06■□□□□ 0
BNIP1Q12981 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC15.06■□□□□ 0
BNIP1Q12981 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.06■□□□□ 0
BNIP1Q12981 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
BNIP1Q12981 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
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BNIP1Q12981 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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BNIP1Q12981 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
BNIP1Q12981 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
BNIP1Q12981 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
BNIP1Q12981 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BNIP1Q12981 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BNIP1Q12981 IFNA6-202ENST00000380210 1544 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
BNIP1Q12981 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
BNIP1Q12981 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
BNIP1Q12981 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BNIP1Q12981 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BNIP1Q12981 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BNIP1Q12981 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BNIP1Q12981 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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BNIP1Q12981 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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BNIP1Q12981 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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BNIP1Q12981 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BNIP1Q12981 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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BNIP1Q12981 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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BNIP1Q12981 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BNIP1Q12981 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BNIP1Q12981 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BNIP1Q12981 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
BNIP1Q12981 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BNIP1Q12981 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BNIP1Q12981 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
BNIP1Q12981 PID1-202ENST00000392054 2745 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
BNIP1Q12981 STRA6-203ENST00000416286 2750 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
BNIP1Q12981 TBC1D9B-208ENST00000519746 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BNIP1Q12981 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
BNIP1Q12981 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
BNIP1Q12981 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BNIP1Q12981 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BNIP1Q12981 ALOX15B-201ENST00000380173 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BNIP1Q12981 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BNIP1Q12981 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
BNIP1Q12981 PNRC2-201ENST00000334351 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BNIP1Q12981 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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