Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
FOXO1Q12778 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
FOXO1Q12778 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
FOXO1Q12778 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
FOXO1Q12778 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
FOXO1Q12778 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
FOXO1Q12778 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
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FOXO1Q12778 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
FOXO1Q12778 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
FOXO1Q12778 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
FOXO1Q12778 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
FOXO1Q12778 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
FOXO1Q12778 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
FOXO1Q12778 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
FOXO1Q12778 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
FOXO1Q12778 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
FOXO1Q12778 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
FOXO1Q12778 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
FOXO1Q12778 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
FOXO1Q12778 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
FOXO1Q12778 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
FOXO1Q12778 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
FOXO1Q12778 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
FOXO1Q12778 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
FOXO1Q12778 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
FOXO1Q12778 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
FOXO1Q12778 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
FOXO1Q12778 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
FOXO1Q12778 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
FOXO1Q12778 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
FOXO1Q12778 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
FOXO1Q12778 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
FOXO1Q12778 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
FOXO1Q12778 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
FOXO1Q12778 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
FOXO1Q12778 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
FOXO1Q12778 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
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FOXO1Q12778 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
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FOXO1Q12778 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
FOXO1Q12778 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
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