Protein–RNA interactions for Protein: Q04446

GBE1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBE1Q04446 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GBE1Q04446 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GBE1Q04446 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GBE1Q04446 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GBE1Q04446 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GBE1Q04446 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GBE1Q04446 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GBE1Q04446 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
GBE1Q04446 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GBE1Q04446 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
GBE1Q04446 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
GBE1Q04446 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GBE1Q04446 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
GBE1Q04446 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GBE1Q04446 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GBE1Q04446 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GBE1Q04446 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GBE1Q04446 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GBE1Q04446 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
GBE1Q04446 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GBE1Q04446 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GBE1Q04446 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
GBE1Q04446 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GBE1Q04446 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GBE1Q04446 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GBE1Q04446 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GBE1Q04446 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GBE1Q04446 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GBE1Q04446 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GBE1Q04446 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GBE1Q04446 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GBE1Q04446 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GBE1Q04446 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GBE1Q04446 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GBE1Q04446 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GBE1Q04446 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GBE1Q04446 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GBE1Q04446 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GBE1Q04446 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GBE1Q04446 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GBE1Q04446 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GBE1Q04446 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GBE1Q04446 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GBE1Q04446 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GBE1Q04446 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GBE1Q04446 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GBE1Q04446 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GBE1Q04446 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GBE1Q04446 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GBE1Q04446 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GBE1Q04446 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GBE1Q04446 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
GBE1Q04446 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GBE1Q04446 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
GBE1Q04446 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GBE1Q04446 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GBE1Q04446 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GBE1Q04446 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GBE1Q04446 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GBE1Q04446 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GBE1Q04446 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GBE1Q04446 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GBE1Q04446 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GBE1Q04446 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GBE1Q04446 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GBE1Q04446 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GBE1Q04446 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GBE1Q04446 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GBE1Q04446 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69 ms