Protein–RNA interactions for Protein: P61221

ABCE1, ATP-binding cassette sub-family E member 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCE1P61221 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ABCE1P61221 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ABCE1P61221 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ABCE1P61221 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ABCE1P61221 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ABCE1P61221 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ABCE1P61221 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ABCE1P61221 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ABCE1P61221 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ABCE1P61221 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ABCE1P61221 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ABCE1P61221 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ABCE1P61221 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ABCE1P61221 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ABCE1P61221 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ABCE1P61221 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ABCE1P61221 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ABCE1P61221 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ABCE1P61221 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ABCE1P61221 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ABCE1P61221 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ABCE1P61221 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ABCE1P61221 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ABCE1P61221 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ABCE1P61221 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ABCE1P61221 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ABCE1P61221 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ABCE1P61221 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ABCE1P61221 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ABCE1P61221 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ABCE1P61221 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ABCE1P61221 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ABCE1P61221 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ABCE1P61221 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ABCE1P61221 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ABCE1P61221 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ABCE1P61221 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ABCE1P61221 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ABCE1P61221 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ABCE1P61221 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ABCE1P61221 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ABCE1P61221 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ABCE1P61221 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ABCE1P61221 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ABCE1P61221 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ABCE1P61221 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ABCE1P61221 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ABCE1P61221 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ABCE1P61221 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ABCE1P61221 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ABCE1P61221 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ABCE1P61221 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ABCE1P61221 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ABCE1P61221 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ABCE1P61221 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ABCE1P61221 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ABCE1P61221 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ABCE1P61221 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ABCE1P61221 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ABCE1P61221 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ABCE1P61221 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ABCE1P61221 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ABCE1P61221 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ABCE1P61221 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ABCE1P61221 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ABCE1P61221 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ABCE1P61221 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ABCE1P61221 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ABCE1P61221 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ABCE1P61221 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ABCE1P61221 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ABCE1P61221 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ABCE1P61221 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ABCE1P61221 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ABCE1P61221 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ABCE1P61221 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ABCE1P61221 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ABCE1P61221 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ABCE1P61221 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ABCE1P61221 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ABCE1P61221 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ABCE1P61221 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ABCE1P61221 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
ABCE1P61221 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ABCE1P61221 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ABCE1P61221 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ABCE1P61221 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ABCE1P61221 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ABCE1P61221 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ABCE1P61221 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ABCE1P61221 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ABCE1P61221 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ABCE1P61221 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ABCE1P61221 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ABCE1P61221 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ABCE1P61221 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ABCE1P61221 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ABCE1P61221 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ABCE1P61221 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ABCE1P61221 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms