Protein–RNA interactions for Protein: P46527

CDKN1B, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN1BP46527 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 AAR2-201ENST00000320849 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 TFIP11-201ENST00000405938 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 ZMIZ1-AS1-203ENST00000456353 2878 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 DMTN-220ENST00000523266 2735 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 RHOH-224ENST00000622175 2254 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 TRIO-202ENST00000344204 11100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 PCDHB5-201ENST00000231134 3408 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 GNPDA1-204ENST00000503794 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 LRRFIP2-202ENST00000354379 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 DENND3-211ENST00000519811 5482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 RIN3-201ENST00000216487 3859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CDKN1BP46527 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms