Protein–RNA interactions for Protein: P0C7Q3

FAM58BP, Putative cyclin-related protein FAM58B, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM58BPP0C7Q3 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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FAM58BPP0C7Q3 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM58BPP0C7Q3 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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FAM58BPP0C7Q3 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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FAM58BPP0C7Q3 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM58BPP0C7Q3 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM58BPP0C7Q3 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM58BPP0C7Q3 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM58BPP0C7Q3 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM58BPP0C7Q3 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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FAM58BPP0C7Q3 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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FAM58BPP0C7Q3 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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FAM58BPP0C7Q3 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM58BPP0C7Q3 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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FAM58BPP0C7Q3 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM58BPP0C7Q3 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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FAM58BPP0C7Q3 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM58BPP0C7Q3 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM58BPP0C7Q3 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM58BPP0C7Q3 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM58BPP0C7Q3 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM58BPP0C7Q3 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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FAM58BPP0C7Q3 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM58BPP0C7Q3 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM58BPP0C7Q3 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM58BPP0C7Q3 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM58BPP0C7Q3 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM58BPP0C7Q3 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM58BPP0C7Q3 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM58BPP0C7Q3 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM58BPP0C7Q3 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM58BPP0C7Q3 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM58BPP0C7Q3 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM58BPP0C7Q3 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM58BPP0C7Q3 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM58BPP0C7Q3 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM58BPP0C7Q3 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM58BPP0C7Q3 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM58BPP0C7Q3 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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