Protein–RNA interactions for Protein: O76041

NEBL, Nebulette, humanhuman

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEBLO76041 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NEBLO76041 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NEBLO76041 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NEBLO76041 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NEBLO76041 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NEBLO76041 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEBLO76041 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEBLO76041 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEBLO76041 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEBLO76041 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEBLO76041 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEBLO76041 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEBLO76041 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEBLO76041 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEBLO76041 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEBLO76041 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEBLO76041 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEBLO76041 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEBLO76041 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEBLO76041 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEBLO76041 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEBLO76041 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEBLO76041 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEBLO76041 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEBLO76041 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEBLO76041 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEBLO76041 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEBLO76041 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEBLO76041 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEBLO76041 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEBLO76041 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEBLO76041 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEBLO76041 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEBLO76041 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEBLO76041 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NEBLO76041 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEBLO76041 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEBLO76041 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEBLO76041 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEBLO76041 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEBLO76041 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEBLO76041 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEBLO76041 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEBLO76041 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEBLO76041 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEBLO76041 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEBLO76041 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEBLO76041 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEBLO76041 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEBLO76041 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEBLO76041 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEBLO76041 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEBLO76041 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEBLO76041 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NEBLO76041 MPLKIP-201ENST00000306984 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NEBLO76041 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NEBLO76041 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NEBLO76041 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NEBLO76041 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NEBLO76041 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NEBLO76041 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NEBLO76041 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NEBLO76041 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NEBLO76041 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NEBLO76041 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NEBLO76041 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NEBLO76041 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NEBLO76041 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NEBLO76041 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NEBLO76041 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NEBLO76041 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NEBLO76041 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NEBLO76041 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NEBLO76041 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NEBLO76041 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NEBLO76041 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NEBLO76041 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NEBLO76041 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NEBLO76041 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NEBLO76041 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NEBLO76041 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NEBLO76041 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NEBLO76041 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NEBLO76041 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NEBLO76041 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NEBLO76041 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NEBLO76041 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NEBLO76041 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NEBLO76041 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NEBLO76041 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NEBLO76041 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NEBLO76041 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NEBLO76041 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NEBLO76041 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NEBLO76041 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NEBLO76041 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NEBLO76041 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NEBLO76041 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NEBLO76041 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NEBLO76041 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms