Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW83

IFT27, Intraflagellar transport protein 27 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT27Q9BW83 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
IFT27Q9BW83 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
IFT27Q9BW83 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
IFT27Q9BW83 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
IFT27Q9BW83 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
IFT27Q9BW83 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
IFT27Q9BW83 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
IFT27Q9BW83 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
IFT27Q9BW83 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
IFT27Q9BW83 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
IFT27Q9BW83 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
IFT27Q9BW83 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
IFT27Q9BW83 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
IFT27Q9BW83 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
IFT27Q9BW83 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
IFT27Q9BW83 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
IFT27Q9BW83 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
IFT27Q9BW83 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
IFT27Q9BW83 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
IFT27Q9BW83 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
IFT27Q9BW83 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
IFT27Q9BW83 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
IFT27Q9BW83 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
IFT27Q9BW83 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
IFT27Q9BW83 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
IFT27Q9BW83 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
IFT27Q9BW83 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
IFT27Q9BW83 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
IFT27Q9BW83 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
IFT27Q9BW83 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
IFT27Q9BW83 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
IFT27Q9BW83 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
IFT27Q9BW83 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
IFT27Q9BW83 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
IFT27Q9BW83 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
IFT27Q9BW83 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
IFT27Q9BW83 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
IFT27Q9BW83 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
IFT27Q9BW83 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
IFT27Q9BW83 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
IFT27Q9BW83 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
IFT27Q9BW83 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
IFT27Q9BW83 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
IFT27Q9BW83 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
IFT27Q9BW83 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
IFT27Q9BW83 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
IFT27Q9BW83 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
IFT27Q9BW83 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
IFT27Q9BW83 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
IFT27Q9BW83 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
IFT27Q9BW83 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
IFT27Q9BW83 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
IFT27Q9BW83 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
IFT27Q9BW83 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
IFT27Q9BW83 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
IFT27Q9BW83 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
IFT27Q9BW83 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
IFT27Q9BW83 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
IFT27Q9BW83 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
IFT27Q9BW83 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
IFT27Q9BW83 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
IFT27Q9BW83 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
IFT27Q9BW83 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
IFT27Q9BW83 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
IFT27Q9BW83 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
IFT27Q9BW83 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
IFT27Q9BW83 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
IFT27Q9BW83 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
IFT27Q9BW83 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
IFT27Q9BW83 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
IFT27Q9BW83 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
IFT27Q9BW83 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
IFT27Q9BW83 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
IFT27Q9BW83 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
IFT27Q9BW83 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
IFT27Q9BW83 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
IFT27Q9BW83 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
IFT27Q9BW83 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
IFT27Q9BW83 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
IFT27Q9BW83 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
IFT27Q9BW83 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
IFT27Q9BW83 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
IFT27Q9BW83 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
IFT27Q9BW83 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
IFT27Q9BW83 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
IFT27Q9BW83 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
IFT27Q9BW83 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
IFT27Q9BW83 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
IFT27Q9BW83 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
IFT27Q9BW83 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
IFT27Q9BW83 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
IFT27Q9BW83 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
IFT27Q9BW83 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
IFT27Q9BW83 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
IFT27Q9BW83 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
IFT27Q9BW83 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
IFT27Q9BW83 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
IFT27Q9BW83 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
IFT27Q9BW83 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
IFT27Q9BW83 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
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