Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWW8

GAB3, GRB2-associated-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAB3Q8WWW8 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GAB3Q8WWW8 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GAB3Q8WWW8 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GAB3Q8WWW8 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GAB3Q8WWW8 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GAB3Q8WWW8 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GAB3Q8WWW8 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GAB3Q8WWW8 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GAB3Q8WWW8 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GAB3Q8WWW8 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GAB3Q8WWW8 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GAB3Q8WWW8 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GAB3Q8WWW8 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GAB3Q8WWW8 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GAB3Q8WWW8 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GAB3Q8WWW8 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GAB3Q8WWW8 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GAB3Q8WWW8 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GAB3Q8WWW8 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GAB3Q8WWW8 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GAB3Q8WWW8 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GAB3Q8WWW8 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GAB3Q8WWW8 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GAB3Q8WWW8 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GAB3Q8WWW8 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GAB3Q8WWW8 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GAB3Q8WWW8 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GAB3Q8WWW8 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GAB3Q8WWW8 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GAB3Q8WWW8 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GAB3Q8WWW8 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GAB3Q8WWW8 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GAB3Q8WWW8 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GAB3Q8WWW8 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GAB3Q8WWW8 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GAB3Q8WWW8 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GAB3Q8WWW8 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GAB3Q8WWW8 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GAB3Q8WWW8 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GAB3Q8WWW8 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GAB3Q8WWW8 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GAB3Q8WWW8 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GAB3Q8WWW8 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GAB3Q8WWW8 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GAB3Q8WWW8 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GAB3Q8WWW8 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GAB3Q8WWW8 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GAB3Q8WWW8 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GAB3Q8WWW8 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GAB3Q8WWW8 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GAB3Q8WWW8 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GAB3Q8WWW8 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GAB3Q8WWW8 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GAB3Q8WWW8 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GAB3Q8WWW8 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GAB3Q8WWW8 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GAB3Q8WWW8 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GAB3Q8WWW8 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GAB3Q8WWW8 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GAB3Q8WWW8 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GAB3Q8WWW8 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GAB3Q8WWW8 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GAB3Q8WWW8 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
GAB3Q8WWW8 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GAB3Q8WWW8 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GAB3Q8WWW8 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GAB3Q8WWW8 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GAB3Q8WWW8 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GAB3Q8WWW8 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GAB3Q8WWW8 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GAB3Q8WWW8 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GAB3Q8WWW8 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GAB3Q8WWW8 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GAB3Q8WWW8 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GAB3Q8WWW8 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GAB3Q8WWW8 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GAB3Q8WWW8 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GAB3Q8WWW8 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
GAB3Q8WWW8 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GAB3Q8WWW8 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GAB3Q8WWW8 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
GAB3Q8WWW8 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GAB3Q8WWW8 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
GAB3Q8WWW8 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GAB3Q8WWW8 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GAB3Q8WWW8 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
GAB3Q8WWW8 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GAB3Q8WWW8 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
GAB3Q8WWW8 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GAB3Q8WWW8 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GAB3Q8WWW8 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
GAB3Q8WWW8 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GAB3Q8WWW8 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GAB3Q8WWW8 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GAB3Q8WWW8 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
GAB3Q8WWW8 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GAB3Q8WWW8 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GAB3Q8WWW8 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GAB3Q8WWW8 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GAB3Q8WWW8 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms