Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCS4

TMEM35B, Transmembrane protein 35B, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM35BQ8NCS4 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM35BQ8NCS4 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM35BQ8NCS4 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM35BQ8NCS4 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM35BQ8NCS4 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM35BQ8NCS4 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM35BQ8NCS4 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM35BQ8NCS4 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM35BQ8NCS4 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM35BQ8NCS4 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM35BQ8NCS4 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM35BQ8NCS4 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM35BQ8NCS4 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM35BQ8NCS4 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM35BQ8NCS4 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM35BQ8NCS4 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM35BQ8NCS4 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM35BQ8NCS4 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM35BQ8NCS4 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM35BQ8NCS4 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM35BQ8NCS4 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM35BQ8NCS4 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM35BQ8NCS4 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM35BQ8NCS4 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM35BQ8NCS4 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM35BQ8NCS4 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM35BQ8NCS4 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM35BQ8NCS4 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM35BQ8NCS4 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM35BQ8NCS4 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM35BQ8NCS4 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM35BQ8NCS4 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM35BQ8NCS4 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM35BQ8NCS4 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM35BQ8NCS4 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM35BQ8NCS4 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM35BQ8NCS4 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM35BQ8NCS4 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM35BQ8NCS4 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM35BQ8NCS4 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM35BQ8NCS4 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM35BQ8NCS4 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM35BQ8NCS4 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM35BQ8NCS4 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM35BQ8NCS4 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM35BQ8NCS4 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM35BQ8NCS4 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM35BQ8NCS4 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM35BQ8NCS4 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM35BQ8NCS4 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM35BQ8NCS4 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM35BQ8NCS4 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM35BQ8NCS4 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM35BQ8NCS4 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM35BQ8NCS4 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM35BQ8NCS4 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM35BQ8NCS4 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM35BQ8NCS4 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM35BQ8NCS4 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM35BQ8NCS4 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM35BQ8NCS4 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM35BQ8NCS4 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM35BQ8NCS4 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM35BQ8NCS4 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM35BQ8NCS4 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM35BQ8NCS4 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM35BQ8NCS4 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM35BQ8NCS4 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM35BQ8NCS4 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM35BQ8NCS4 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM35BQ8NCS4 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM35BQ8NCS4 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM35BQ8NCS4 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM35BQ8NCS4 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM35BQ8NCS4 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM35BQ8NCS4 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM35BQ8NCS4 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM35BQ8NCS4 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM35BQ8NCS4 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM35BQ8NCS4 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM35BQ8NCS4 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM35BQ8NCS4 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM35BQ8NCS4 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM35BQ8NCS4 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM35BQ8NCS4 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM35BQ8NCS4 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM35BQ8NCS4 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM35BQ8NCS4 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM35BQ8NCS4 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM35BQ8NCS4 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM35BQ8NCS4 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM35BQ8NCS4 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM35BQ8NCS4 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM35BQ8NCS4 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM35BQ8NCS4 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM35BQ8NCS4 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM35BQ8NCS4 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM35BQ8NCS4 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM35BQ8NCS4 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM35BQ8NCS4 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms