Protein–RNA interactions for Protein: Q15645

TRIP13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP13Q15645 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms