Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RUNX3Q13761 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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