Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

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Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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