Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP7AQ04656 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP7AQ04656 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP7AQ04656 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP7AQ04656 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP7AQ04656 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP7AQ04656 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP7AQ04656 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATP7AQ04656 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP7AQ04656 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP7AQ04656 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP7AQ04656 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP7AQ04656 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP7AQ04656 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP7AQ04656 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP7AQ04656 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP7AQ04656 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP7AQ04656 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP7AQ04656 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP7AQ04656 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP7AQ04656 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP7AQ04656 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP7AQ04656 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP7AQ04656 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP7AQ04656 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP7AQ04656 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP7AQ04656 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP7AQ04656 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP7AQ04656 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP7AQ04656 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP7AQ04656 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP7AQ04656 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP7AQ04656 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP7AQ04656 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP7AQ04656 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP7AQ04656 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP7AQ04656 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP7AQ04656 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP7AQ04656 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP7AQ04656 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP7AQ04656 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP7AQ04656 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP7AQ04656 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP7AQ04656 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP7AQ04656 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP7AQ04656 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP7AQ04656 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP7AQ04656 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP7AQ04656 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP7AQ04656 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP7AQ04656 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP7AQ04656 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP7AQ04656 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP7AQ04656 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP7AQ04656 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP7AQ04656 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP7AQ04656 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP7AQ04656 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP7AQ04656 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP7AQ04656 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP7AQ04656 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP7AQ04656 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP7AQ04656 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP7AQ04656 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP7AQ04656 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP7AQ04656 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP7AQ04656 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP7AQ04656 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP7AQ04656 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP7AQ04656 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP7AQ04656 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP7AQ04656 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP7AQ04656 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP7AQ04656 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP7AQ04656 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP7AQ04656 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP7AQ04656 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP7AQ04656 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP7AQ04656 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP7AQ04656 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP7AQ04656 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP7AQ04656 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP7AQ04656 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP7AQ04656 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP7AQ04656 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP7AQ04656 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP7AQ04656 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP7AQ04656 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP7AQ04656 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP7AQ04656 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP7AQ04656 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP7AQ04656 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP7AQ04656 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP7AQ04656 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP7AQ04656 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP7AQ04656 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP7AQ04656 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP7AQ04656 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP7AQ04656 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP7AQ04656 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms