Protein–RNA interactions for Protein: P81133

SIM1, Single-minded homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIM1P81133 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SIM1P81133 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SIM1P81133 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SIM1P81133 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SIM1P81133 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SIM1P81133 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SIM1P81133 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SIM1P81133 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SIM1P81133 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SIM1P81133 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SIM1P81133 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SIM1P81133 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SIM1P81133 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SIM1P81133 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SIM1P81133 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SIM1P81133 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SIM1P81133 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SIM1P81133 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SIM1P81133 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SIM1P81133 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SIM1P81133 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SIM1P81133 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SIM1P81133 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SIM1P81133 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SIM1P81133 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SIM1P81133 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SIM1P81133 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SIM1P81133 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SIM1P81133 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SIM1P81133 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SIM1P81133 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SIM1P81133 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SIM1P81133 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SIM1P81133 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SIM1P81133 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SIM1P81133 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SIM1P81133 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SIM1P81133 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SIM1P81133 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SIM1P81133 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SIM1P81133 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SIM1P81133 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SIM1P81133 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SIM1P81133 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SIM1P81133 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SIM1P81133 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SIM1P81133 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SIM1P81133 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SIM1P81133 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SIM1P81133 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SIM1P81133 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SIM1P81133 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SIM1P81133 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SIM1P81133 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SIM1P81133 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SIM1P81133 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SIM1P81133 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SIM1P81133 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SIM1P81133 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SIM1P81133 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SIM1P81133 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SIM1P81133 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SIM1P81133 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SIM1P81133 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SIM1P81133 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SIM1P81133 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SIM1P81133 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SIM1P81133 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SIM1P81133 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SIM1P81133 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SIM1P81133 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SIM1P81133 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SIM1P81133 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SIM1P81133 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SIM1P81133 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SIM1P81133 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SIM1P81133 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SIM1P81133 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SIM1P81133 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SIM1P81133 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SIM1P81133 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SIM1P81133 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SIM1P81133 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SIM1P81133 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SIM1P81133 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SIM1P81133 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SIM1P81133 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SIM1P81133 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SIM1P81133 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SIM1P81133 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SIM1P81133 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SIM1P81133 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SIM1P81133 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SIM1P81133 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SIM1P81133 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SIM1P81133 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SIM1P81133 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SIM1P81133 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SIM1P81133 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SIM1P81133 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms