Protein–RNA interactions for Protein: P56597

NME5, Nucleoside diphosphate kinase homolog 5, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME5P56597 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NME5P56597 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NME5P56597 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NME5P56597 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NME5P56597 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NME5P56597 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NME5P56597 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NME5P56597 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NME5P56597 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NME5P56597 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NME5P56597 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NME5P56597 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NME5P56597 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
NME5P56597 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NME5P56597 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NME5P56597 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
NME5P56597 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NME5P56597 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NME5P56597 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NME5P56597 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
NME5P56597 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
NME5P56597 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
NME5P56597 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NME5P56597 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NME5P56597 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NME5P56597 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NME5P56597 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NME5P56597 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NME5P56597 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NME5P56597 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NME5P56597 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NME5P56597 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NME5P56597 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NME5P56597 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NME5P56597 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NME5P56597 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NME5P56597 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NME5P56597 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NME5P56597 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NME5P56597 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NME5P56597 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NME5P56597 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NME5P56597 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NME5P56597 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NME5P56597 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NME5P56597 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NME5P56597 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NME5P56597 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NME5P56597 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NME5P56597 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NME5P56597 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NME5P56597 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NME5P56597 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NME5P56597 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NME5P56597 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NME5P56597 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NME5P56597 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NME5P56597 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NME5P56597 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NME5P56597 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NME5P56597 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NME5P56597 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NME5P56597 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NME5P56597 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NME5P56597 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NME5P56597 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NME5P56597 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NME5P56597 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NME5P56597 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NME5P56597 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NME5P56597 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NME5P56597 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NME5P56597 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NME5P56597 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NME5P56597 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NME5P56597 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NME5P56597 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NME5P56597 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NME5P56597 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NME5P56597 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NME5P56597 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
NME5P56597 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NME5P56597 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NME5P56597 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NME5P56597 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NME5P56597 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
NME5P56597 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NME5P56597 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
NME5P56597 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
NME5P56597 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NME5P56597 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NME5P56597 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NME5P56597 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NME5P56597 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NME5P56597 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NME5P56597 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NME5P56597 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NME5P56597 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NME5P56597 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NME5P56597 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms