Protein–RNA interactions for Protein: P55773

CCL23, C-C motif chemokine 23, humanhuman

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL23P55773 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCL23P55773 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCL23P55773 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCL23P55773 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCL23P55773 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCL23P55773 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCL23P55773 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCL23P55773 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCL23P55773 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCL23P55773 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCL23P55773 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCL23P55773 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCL23P55773 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCL23P55773 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCL23P55773 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCL23P55773 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCL23P55773 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCL23P55773 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCL23P55773 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCL23P55773 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCL23P55773 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCL23P55773 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCL23P55773 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCL23P55773 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CCL23P55773 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCL23P55773 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CCL23P55773 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CCL23P55773 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCL23P55773 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCL23P55773 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCL23P55773 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCL23P55773 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCL23P55773 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCL23P55773 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CCL23P55773 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CCL23P55773 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCL23P55773 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCL23P55773 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCL23P55773 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCL23P55773 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCL23P55773 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCL23P55773 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCL23P55773 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCL23P55773 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCL23P55773 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCL23P55773 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CCL23P55773 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCL23P55773 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCL23P55773 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCL23P55773 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCL23P55773 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCL23P55773 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCL23P55773 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCL23P55773 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCL23P55773 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCL23P55773 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCL23P55773 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCL23P55773 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCL23P55773 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCL23P55773 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCL23P55773 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCL23P55773 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCL23P55773 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CCL23P55773 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCL23P55773 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCL23P55773 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCL23P55773 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCL23P55773 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCL23P55773 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCL23P55773 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CCL23P55773 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CCL23P55773 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCL23P55773 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CCL23P55773 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCL23P55773 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCL23P55773 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CCL23P55773 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCL23P55773 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCL23P55773 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCL23P55773 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCL23P55773 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCL23P55773 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCL23P55773 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCL23P55773 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCL23P55773 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCL23P55773 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCL23P55773 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCL23P55773 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCL23P55773 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCL23P55773 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCL23P55773 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCL23P55773 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCL23P55773 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCL23P55773 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CCL23P55773 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCL23P55773 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCL23P55773 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CCL23P55773 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCL23P55773 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCL23P55773 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms