Protein–RNA interactions for Protein: P48147

PREP, Prolyl endopeptidase, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PREPP48147 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PREPP48147 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PREPP48147 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PREPP48147 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PREPP48147 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PREPP48147 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PREPP48147 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PREPP48147 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PREPP48147 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PREPP48147 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PREPP48147 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PREPP48147 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PREPP48147 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PREPP48147 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PREPP48147 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PREPP48147 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PREPP48147 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PREPP48147 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PREPP48147 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PREPP48147 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PREPP48147 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PREPP48147 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PREPP48147 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PREPP48147 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PREPP48147 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PREPP48147 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PREPP48147 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PREPP48147 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PREPP48147 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PREPP48147 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PREPP48147 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PREPP48147 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PREPP48147 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PREPP48147 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PREPP48147 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PREPP48147 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PREPP48147 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PREPP48147 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PREPP48147 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PREPP48147 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PREPP48147 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PREPP48147 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PREPP48147 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PREPP48147 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PREPP48147 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PREPP48147 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PREPP48147 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PREPP48147 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PREPP48147 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PREPP48147 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PREPP48147 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PREPP48147 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PREPP48147 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PREPP48147 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PREPP48147 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PREPP48147 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PREPP48147 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PREPP48147 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PREPP48147 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PREPP48147 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PREPP48147 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PREPP48147 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PREPP48147 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PREPP48147 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PREPP48147 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PREPP48147 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PREPP48147 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PREPP48147 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PREPP48147 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PREPP48147 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PREPP48147 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PREPP48147 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PREPP48147 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PREPP48147 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PREPP48147 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PREPP48147 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PREPP48147 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PREPP48147 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PREPP48147 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PREPP48147 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PREPP48147 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PREPP48147 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PREPP48147 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PREPP48147 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PREPP48147 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PREPP48147 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PREPP48147 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PREPP48147 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PREPP48147 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PREPP48147 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PREPP48147 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PREPP48147 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PREPP48147 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PREPP48147 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PREPP48147 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PREPP48147 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PREPP48147 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PREPP48147 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PREPP48147 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PREPP48147 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms