Protein–RNA interactions for Protein: P25054

APC, Adenomatous polyposis coli protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APCP25054 HCG9-201ENST00000376800 663 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
APCP25054 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
APCP25054 PPM1N-201ENST00000396735 895 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
APCP25054 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
APCP25054 DPY19L2P5-201ENST00000456300 331 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
APCP25054 PPM1N-208ENST00000456399 618 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
APCP25054 ZSCAN2-208ENST00000485222 910 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
APCP25054 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
APCP25054 ZSCAN2-210ENST00000538076 1109 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
APCP25054 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
APCP25054 SNX11-210ENST00000582104 1282 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
APCP25054 AC009950.1-210ENST00000594622 553 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
APCP25054 AC140113.1-201ENST00000603467 169 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
APCP25054 PSMD5-208ENST00000625444 219 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
APCP25054 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
APCP25054 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
APCP25054 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
APCP25054 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
APCP25054 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
APCP25054 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
APCP25054 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
APCP25054 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
APCP25054 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
APCP25054 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
APCP25054 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
APCP25054 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
APCP25054 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
APCP25054 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
APCP25054 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
APCP25054 RN7SL494P-201ENST00000461517 304 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
APCP25054 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
APCP25054 AC020659.1-202ENST00000564432 531 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
APCP25054 BRSK1-203ENST00000585418 1104 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
APCP25054 AC090510.3-201ENST00000615831 821 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
APCP25054 CSAG3-203ENST00000638835 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
APCP25054 CSAG2-204ENST00000640702 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
APCP25054 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
APCP25054 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
APCP25054 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
APCP25054 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
APCP25054 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
APCP25054 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
APCP25054 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
APCP25054 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
APCP25054 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
APCP25054 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
APCP25054 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
APCP25054 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
APCP25054 LIF-202ENST00000403987 592 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
APCP25054 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
APCP25054 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
APCP25054 GDNF-207ENST00000515058 764 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
APCP25054 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
APCP25054 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
APCP25054 AC090001.1-201ENST00000553194 467 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
APCP25054 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
APCP25054 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
APCP25054 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
APCP25054 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
APCP25054 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
APCP25054 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
APCP25054 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
APCP25054 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
APCP25054 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
APCP25054 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
APCP25054 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
APCP25054 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
APCP25054 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
APCP25054 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
APCP25054 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
APCP25054 ZNF226-201ENST00000300823 817 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
APCP25054 C7orf61-201ENST00000332375 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
APCP25054 ZNF286A-201ENST00000395893 654 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
APCP25054 OST4-201ENST00000429985 559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
APCP25054 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
APCP25054 SOX2-OT-208ENST00000477928 902 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
APCP25054 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
APCP25054 RAP1B-216ENST00000537460 1072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
APCP25054 AC079949.1-201ENST00000541419 505 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
APCP25054 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
APCP25054 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
APCP25054 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
APCP25054 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
APCP25054 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
APCP25054 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
APCP25054 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
APCP25054 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
APCP25054 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
APCP25054 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
APCP25054 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
APCP25054 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
APCP25054 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
APCP25054 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
APCP25054 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
APCP25054 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
APCP25054 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
APCP25054 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
APCP25054 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
APCP25054 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
APCP25054 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms