Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms