Protein–RNA interactions for Protein: P36542

ATP5C1, ATP synthase subunit gamma, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5C1P36542 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP5C1P36542 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATP5C1P36542 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATP5C1P36542 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATP5C1P36542 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATP5C1P36542 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATP5C1P36542 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATP5C1P36542 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATP5C1P36542 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATP5C1P36542 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATP5C1P36542 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATP5C1P36542 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATP5C1P36542 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATP5C1P36542 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATP5C1P36542 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATP5C1P36542 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP5C1P36542 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP5C1P36542 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP5C1P36542 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP5C1P36542 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP5C1P36542 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP5C1P36542 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP5C1P36542 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP5C1P36542 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP5C1P36542 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP5C1P36542 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP5C1P36542 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP5C1P36542 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP5C1P36542 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP5C1P36542 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP5C1P36542 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP5C1P36542 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP5C1P36542 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP5C1P36542 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP5C1P36542 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP5C1P36542 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP5C1P36542 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP5C1P36542 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP5C1P36542 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP5C1P36542 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP5C1P36542 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP5C1P36542 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP5C1P36542 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP5C1P36542 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP5C1P36542 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP5C1P36542 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP5C1P36542 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP5C1P36542 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP5C1P36542 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP5C1P36542 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP5C1P36542 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP5C1P36542 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP5C1P36542 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP5C1P36542 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP5C1P36542 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP5C1P36542 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP5C1P36542 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP5C1P36542 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP5C1P36542 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP5C1P36542 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP5C1P36542 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP5C1P36542 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP5C1P36542 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP5C1P36542 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP5C1P36542 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP5C1P36542 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP5C1P36542 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP5C1P36542 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms