Protein–RNA interactions for Protein: O95977

S1PR4, Sphingosine 1-phosphate receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
S1PR4O95977 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
S1PR4O95977 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
S1PR4O95977 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
S1PR4O95977 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
S1PR4O95977 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
S1PR4O95977 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
S1PR4O95977 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
S1PR4O95977 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
S1PR4O95977 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
S1PR4O95977 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
S1PR4O95977 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
S1PR4O95977 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
S1PR4O95977 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
S1PR4O95977 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
S1PR4O95977 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
S1PR4O95977 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
S1PR4O95977 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
S1PR4O95977 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
S1PR4O95977 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
S1PR4O95977 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
S1PR4O95977 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
S1PR4O95977 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
S1PR4O95977 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
S1PR4O95977 RPL23A-204ENST00000422514 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
S1PR4O95977 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
S1PR4O95977 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
S1PR4O95977 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
S1PR4O95977 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
S1PR4O95977 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
S1PR4O95977 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
S1PR4O95977 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
S1PR4O95977 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
S1PR4O95977 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
S1PR4O95977 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
S1PR4O95977 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
S1PR4O95977 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
S1PR4O95977 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
S1PR4O95977 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
S1PR4O95977 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
S1PR4O95977 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
S1PR4O95977 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
S1PR4O95977 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
S1PR4O95977 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
S1PR4O95977 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
S1PR4O95977 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
S1PR4O95977 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
S1PR4O95977 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
S1PR4O95977 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
S1PR4O95977 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
S1PR4O95977 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
S1PR4O95977 KATNBL1P2-201ENST00000433311 835 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
S1PR4O95977 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
S1PR4O95977 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
S1PR4O95977 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
S1PR4O95977 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
S1PR4O95977 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
S1PR4O95977 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
S1PR4O95977 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
S1PR4O95977 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
S1PR4O95977 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
S1PR4O95977 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
S1PR4O95977 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
S1PR4O95977 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
S1PR4O95977 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
S1PR4O95977 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
S1PR4O95977 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
S1PR4O95977 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
S1PR4O95977 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
S1PR4O95977 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
S1PR4O95977 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
S1PR4O95977 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
S1PR4O95977 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
S1PR4O95977 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
S1PR4O95977 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
S1PR4O95977 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
S1PR4O95977 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
S1PR4O95977 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
S1PR4O95977 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
S1PR4O95977 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
S1PR4O95977 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
S1PR4O95977 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
S1PR4O95977 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
S1PR4O95977 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
S1PR4O95977 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
S1PR4O95977 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
S1PR4O95977 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
S1PR4O95977 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
S1PR4O95977 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
S1PR4O95977 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
S1PR4O95977 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
S1PR4O95977 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
S1PR4O95977 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
S1PR4O95977 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
S1PR4O95977 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
S1PR4O95977 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
S1PR4O95977 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
S1PR4O95977 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
S1PR4O95977 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
S1PR4O95977 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
S1PR4O95977 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms