Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Q3

TMED3, Transmembrane emp24 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED3Q9Y3Q3 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TMED3Q9Y3Q3 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TMED3Q9Y3Q3 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TMED3Q9Y3Q3 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TMED3Q9Y3Q3 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TMED3Q9Y3Q3 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TMED3Q9Y3Q3 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TMED3Q9Y3Q3 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
TMED3Q9Y3Q3 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TMED3Q9Y3Q3 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TMED3Q9Y3Q3 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TMED3Q9Y3Q3 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TMED3Q9Y3Q3 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TMED3Q9Y3Q3 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TMED3Q9Y3Q3 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TMED3Q9Y3Q3 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TMED3Q9Y3Q3 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TMED3Q9Y3Q3 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TMED3Q9Y3Q3 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TMED3Q9Y3Q3 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TMED3Q9Y3Q3 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TMED3Q9Y3Q3 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TMED3Q9Y3Q3 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TMED3Q9Y3Q3 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TMED3Q9Y3Q3 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TMED3Q9Y3Q3 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TMED3Q9Y3Q3 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TMED3Q9Y3Q3 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TMED3Q9Y3Q3 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TMED3Q9Y3Q3 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
TMED3Q9Y3Q3 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMED3Q9Y3Q3 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMED3Q9Y3Q3 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMED3Q9Y3Q3 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMED3Q9Y3Q3 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMED3Q9Y3Q3 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMED3Q9Y3Q3 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMED3Q9Y3Q3 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMED3Q9Y3Q3 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMED3Q9Y3Q3 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMED3Q9Y3Q3 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMED3Q9Y3Q3 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMED3Q9Y3Q3 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMED3Q9Y3Q3 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMED3Q9Y3Q3 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMED3Q9Y3Q3 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMED3Q9Y3Q3 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMED3Q9Y3Q3 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMED3Q9Y3Q3 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMED3Q9Y3Q3 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMED3Q9Y3Q3 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMED3Q9Y3Q3 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMED3Q9Y3Q3 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMED3Q9Y3Q3 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMED3Q9Y3Q3 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMED3Q9Y3Q3 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMED3Q9Y3Q3 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMED3Q9Y3Q3 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMED3Q9Y3Q3 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMED3Q9Y3Q3 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMED3Q9Y3Q3 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMED3Q9Y3Q3 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMED3Q9Y3Q3 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMED3Q9Y3Q3 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMED3Q9Y3Q3 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMED3Q9Y3Q3 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMED3Q9Y3Q3 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMED3Q9Y3Q3 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMED3Q9Y3Q3 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
TMED3Q9Y3Q3 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMED3Q9Y3Q3 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMED3Q9Y3Q3 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMED3Q9Y3Q3 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMED3Q9Y3Q3 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
TMED3Q9Y3Q3 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMED3Q9Y3Q3 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMED3Q9Y3Q3 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMED3Q9Y3Q3 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMED3Q9Y3Q3 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMED3Q9Y3Q3 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMED3Q9Y3Q3 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMED3Q9Y3Q3 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMED3Q9Y3Q3 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMED3Q9Y3Q3 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMED3Q9Y3Q3 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMED3Q9Y3Q3 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMED3Q9Y3Q3 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMED3Q9Y3Q3 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMED3Q9Y3Q3 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMED3Q9Y3Q3 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMED3Q9Y3Q3 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMED3Q9Y3Q3 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMED3Q9Y3Q3 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMED3Q9Y3Q3 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
TMED3Q9Y3Q3 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMED3Q9Y3Q3 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMED3Q9Y3Q3 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMED3Q9Y3Q3 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMED3Q9Y3Q3 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMED3Q9Y3Q3 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms