Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN30

SCML1, Sex comb on midleg-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCML1Q9UN30 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCML1Q9UN30 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCML1Q9UN30 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SCML1Q9UN30 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SCML1Q9UN30 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCML1Q9UN30 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCML1Q9UN30 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCML1Q9UN30 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCML1Q9UN30 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCML1Q9UN30 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCML1Q9UN30 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCML1Q9UN30 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCML1Q9UN30 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCML1Q9UN30 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SCML1Q9UN30 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCML1Q9UN30 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCML1Q9UN30 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCML1Q9UN30 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCML1Q9UN30 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCML1Q9UN30 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCML1Q9UN30 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCML1Q9UN30 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCML1Q9UN30 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCML1Q9UN30 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCML1Q9UN30 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCML1Q9UN30 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCML1Q9UN30 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCML1Q9UN30 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCML1Q9UN30 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCML1Q9UN30 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCML1Q9UN30 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCML1Q9UN30 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCML1Q9UN30 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCML1Q9UN30 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCML1Q9UN30 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCML1Q9UN30 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCML1Q9UN30 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCML1Q9UN30 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCML1Q9UN30 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCML1Q9UN30 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCML1Q9UN30 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCML1Q9UN30 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCML1Q9UN30 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCML1Q9UN30 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
SCML1Q9UN30 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCML1Q9UN30 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCML1Q9UN30 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCML1Q9UN30 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCML1Q9UN30 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCML1Q9UN30 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCML1Q9UN30 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCML1Q9UN30 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCML1Q9UN30 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCML1Q9UN30 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SCML1Q9UN30 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCML1Q9UN30 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCML1Q9UN30 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCML1Q9UN30 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCML1Q9UN30 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SCML1Q9UN30 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCML1Q9UN30 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SCML1Q9UN30 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCML1Q9UN30 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCML1Q9UN30 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCML1Q9UN30 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCML1Q9UN30 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCML1Q9UN30 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCML1Q9UN30 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCML1Q9UN30 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SCML1Q9UN30 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCML1Q9UN30 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCML1Q9UN30 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SCML1Q9UN30 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCML1Q9UN30 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SCML1Q9UN30 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCML1Q9UN30 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCML1Q9UN30 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SCML1Q9UN30 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCML1Q9UN30 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SCML1Q9UN30 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCML1Q9UN30 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCML1Q9UN30 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCML1Q9UN30 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCML1Q9UN30 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCML1Q9UN30 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCML1Q9UN30 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCML1Q9UN30 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCML1Q9UN30 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCML1Q9UN30 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCML1Q9UN30 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCML1Q9UN30 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCML1Q9UN30 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCML1Q9UN30 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCML1Q9UN30 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCML1Q9UN30 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCML1Q9UN30 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCML1Q9UN30 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCML1Q9UN30 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCML1Q9UN30 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SCML1Q9UN30 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 556.9 ms