Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKG4

SLC13A4, Solute carrier family 13 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC13A4Q9UKG4 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC13A4Q9UKG4 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC13A4Q9UKG4 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC13A4Q9UKG4 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC13A4Q9UKG4 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC13A4Q9UKG4 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC13A4Q9UKG4 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC13A4Q9UKG4 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC13A4Q9UKG4 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC13A4Q9UKG4 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC13A4Q9UKG4 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC13A4Q9UKG4 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC13A4Q9UKG4 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC13A4Q9UKG4 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC13A4Q9UKG4 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC13A4Q9UKG4 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLC13A4Q9UKG4 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLC13A4Q9UKG4 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLC13A4Q9UKG4 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLC13A4Q9UKG4 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC13A4Q9UKG4 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC13A4Q9UKG4 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC13A4Q9UKG4 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC13A4Q9UKG4 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC13A4Q9UKG4 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC13A4Q9UKG4 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC13A4Q9UKG4 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC13A4Q9UKG4 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC13A4Q9UKG4 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC13A4Q9UKG4 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC13A4Q9UKG4 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC13A4Q9UKG4 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC13A4Q9UKG4 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC13A4Q9UKG4 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC13A4Q9UKG4 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC13A4Q9UKG4 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC13A4Q9UKG4 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC13A4Q9UKG4 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC13A4Q9UKG4 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC13A4Q9UKG4 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC13A4Q9UKG4 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC13A4Q9UKG4 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC13A4Q9UKG4 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC13A4Q9UKG4 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC13A4Q9UKG4 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC13A4Q9UKG4 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC13A4Q9UKG4 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC13A4Q9UKG4 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC13A4Q9UKG4 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC13A4Q9UKG4 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC13A4Q9UKG4 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC13A4Q9UKG4 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC13A4Q9UKG4 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC13A4Q9UKG4 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC13A4Q9UKG4 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC13A4Q9UKG4 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC13A4Q9UKG4 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC13A4Q9UKG4 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC13A4Q9UKG4 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC13A4Q9UKG4 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC13A4Q9UKG4 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC13A4Q9UKG4 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC13A4Q9UKG4 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC13A4Q9UKG4 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC13A4Q9UKG4 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC13A4Q9UKG4 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC13A4Q9UKG4 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC13A4Q9UKG4 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC13A4Q9UKG4 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC13A4Q9UKG4 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC13A4Q9UKG4 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC13A4Q9UKG4 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC13A4Q9UKG4 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC13A4Q9UKG4 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC13A4Q9UKG4 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC13A4Q9UKG4 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC13A4Q9UKG4 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC13A4Q9UKG4 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC13A4Q9UKG4 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC13A4Q9UKG4 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC13A4Q9UKG4 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC13A4Q9UKG4 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC13A4Q9UKG4 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC13A4Q9UKG4 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC13A4Q9UKG4 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC13A4Q9UKG4 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC13A4Q9UKG4 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC13A4Q9UKG4 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC13A4Q9UKG4 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC13A4Q9UKG4 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC13A4Q9UKG4 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC13A4Q9UKG4 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC13A4Q9UKG4 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC13A4Q9UKG4 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC13A4Q9UKG4 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC13A4Q9UKG4 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC13A4Q9UKG4 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC13A4Q9UKG4 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC13A4Q9UKG4 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC13A4Q9UKG4 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 165.1 ms