Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHD1

CHORDC1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHORDC1Q9UHD1 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHORDC1Q9UHD1 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHORDC1Q9UHD1 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHORDC1Q9UHD1 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHORDC1Q9UHD1 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHORDC1Q9UHD1 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHORDC1Q9UHD1 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHORDC1Q9UHD1 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHORDC1Q9UHD1 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CHORDC1Q9UHD1 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CHORDC1Q9UHD1 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CHORDC1Q9UHD1 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHORDC1Q9UHD1 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHORDC1Q9UHD1 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHORDC1Q9UHD1 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHORDC1Q9UHD1 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHORDC1Q9UHD1 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHORDC1Q9UHD1 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHORDC1Q9UHD1 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHORDC1Q9UHD1 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHORDC1Q9UHD1 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHORDC1Q9UHD1 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHORDC1Q9UHD1 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHORDC1Q9UHD1 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHORDC1Q9UHD1 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHORDC1Q9UHD1 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHORDC1Q9UHD1 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHORDC1Q9UHD1 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHORDC1Q9UHD1 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHORDC1Q9UHD1 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CHORDC1Q9UHD1 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHORDC1Q9UHD1 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHORDC1Q9UHD1 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHORDC1Q9UHD1 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHORDC1Q9UHD1 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CHORDC1Q9UHD1 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHORDC1Q9UHD1 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHORDC1Q9UHD1 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHORDC1Q9UHD1 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHORDC1Q9UHD1 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHORDC1Q9UHD1 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHORDC1Q9UHD1 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHORDC1Q9UHD1 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CHORDC1Q9UHD1 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHORDC1Q9UHD1 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHORDC1Q9UHD1 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHORDC1Q9UHD1 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHORDC1Q9UHD1 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHORDC1Q9UHD1 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHORDC1Q9UHD1 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHORDC1Q9UHD1 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHORDC1Q9UHD1 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHORDC1Q9UHD1 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHORDC1Q9UHD1 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHORDC1Q9UHD1 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHORDC1Q9UHD1 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHORDC1Q9UHD1 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHORDC1Q9UHD1 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CHORDC1Q9UHD1 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CHORDC1Q9UHD1 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHORDC1Q9UHD1 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHORDC1Q9UHD1 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHORDC1Q9UHD1 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHORDC1Q9UHD1 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHORDC1Q9UHD1 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHORDC1Q9UHD1 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHORDC1Q9UHD1 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHORDC1Q9UHD1 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHORDC1Q9UHD1 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHORDC1Q9UHD1 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHORDC1Q9UHD1 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHORDC1Q9UHD1 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHORDC1Q9UHD1 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CHORDC1Q9UHD1 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHORDC1Q9UHD1 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHORDC1Q9UHD1 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHORDC1Q9UHD1 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHORDC1Q9UHD1 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHORDC1Q9UHD1 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHORDC1Q9UHD1 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHORDC1Q9UHD1 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHORDC1Q9UHD1 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHORDC1Q9UHD1 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHORDC1Q9UHD1 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHORDC1Q9UHD1 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHORDC1Q9UHD1 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHORDC1Q9UHD1 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHORDC1Q9UHD1 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CHORDC1Q9UHD1 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CHORDC1Q9UHD1 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHORDC1Q9UHD1 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHORDC1Q9UHD1 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHORDC1Q9UHD1 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHORDC1Q9UHD1 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHORDC1Q9UHD1 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHORDC1Q9UHD1 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHORDC1Q9UHD1 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHORDC1Q9UHD1 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHORDC1Q9UHD1 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHORDC1Q9UHD1 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms