Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH77

KLHL3, Kelch-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL3Q9UH77 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KLHL3Q9UH77 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KLHL3Q9UH77 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KLHL3Q9UH77 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KLHL3Q9UH77 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
KLHL3Q9UH77 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KLHL3Q9UH77 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KLHL3Q9UH77 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KLHL3Q9UH77 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KLHL3Q9UH77 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KLHL3Q9UH77 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KLHL3Q9UH77 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KLHL3Q9UH77 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
KLHL3Q9UH77 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KLHL3Q9UH77 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KLHL3Q9UH77 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KLHL3Q9UH77 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KLHL3Q9UH77 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KLHL3Q9UH77 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KLHL3Q9UH77 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KLHL3Q9UH77 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KLHL3Q9UH77 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KLHL3Q9UH77 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KLHL3Q9UH77 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KLHL3Q9UH77 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KLHL3Q9UH77 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KLHL3Q9UH77 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KLHL3Q9UH77 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KLHL3Q9UH77 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KLHL3Q9UH77 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KLHL3Q9UH77 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KLHL3Q9UH77 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KLHL3Q9UH77 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KLHL3Q9UH77 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KLHL3Q9UH77 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KLHL3Q9UH77 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KLHL3Q9UH77 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KLHL3Q9UH77 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KLHL3Q9UH77 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
KLHL3Q9UH77 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KLHL3Q9UH77 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KLHL3Q9UH77 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KLHL3Q9UH77 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KLHL3Q9UH77 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KLHL3Q9UH77 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KLHL3Q9UH77 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KLHL3Q9UH77 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KLHL3Q9UH77 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KLHL3Q9UH77 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KLHL3Q9UH77 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
KLHL3Q9UH77 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KLHL3Q9UH77 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KLHL3Q9UH77 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
KLHL3Q9UH77 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
KLHL3Q9UH77 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KLHL3Q9UH77 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KLHL3Q9UH77 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KLHL3Q9UH77 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KLHL3Q9UH77 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KLHL3Q9UH77 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KLHL3Q9UH77 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KLHL3Q9UH77 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KLHL3Q9UH77 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KLHL3Q9UH77 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KLHL3Q9UH77 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
KLHL3Q9UH77 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KLHL3Q9UH77 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KLHL3Q9UH77 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KLHL3Q9UH77 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KLHL3Q9UH77 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KLHL3Q9UH77 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KLHL3Q9UH77 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
KLHL3Q9UH77 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KLHL3Q9UH77 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KLHL3Q9UH77 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KLHL3Q9UH77 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KLHL3Q9UH77 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KLHL3Q9UH77 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KLHL3Q9UH77 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KLHL3Q9UH77 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KLHL3Q9UH77 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KLHL3Q9UH77 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KLHL3Q9UH77 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
KLHL3Q9UH77 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
KLHL3Q9UH77 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KLHL3Q9UH77 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KLHL3Q9UH77 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KLHL3Q9UH77 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KLHL3Q9UH77 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KLHL3Q9UH77 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KLHL3Q9UH77 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KLHL3Q9UH77 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KLHL3Q9UH77 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KLHL3Q9UH77 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KLHL3Q9UH77 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KLHL3Q9UH77 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KLHL3Q9UH77 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KLHL3Q9UH77 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLHL3Q9UH77 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLHL3Q9UH77 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms