Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWW7

C2orf42, Uncharacterized protein C2orf42, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf42Q9NWW7 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
C2orf42Q9NWW7 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
C2orf42Q9NWW7 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
C2orf42Q9NWW7 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
C2orf42Q9NWW7 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
C2orf42Q9NWW7 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
C2orf42Q9NWW7 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
C2orf42Q9NWW7 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
C2orf42Q9NWW7 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
C2orf42Q9NWW7 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
C2orf42Q9NWW7 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
C2orf42Q9NWW7 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
C2orf42Q9NWW7 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
C2orf42Q9NWW7 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
C2orf42Q9NWW7 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
C2orf42Q9NWW7 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
C2orf42Q9NWW7 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
C2orf42Q9NWW7 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C2orf42Q9NWW7 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C2orf42Q9NWW7 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C2orf42Q9NWW7 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C2orf42Q9NWW7 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C2orf42Q9NWW7 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
C2orf42Q9NWW7 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
C2orf42Q9NWW7 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C2orf42Q9NWW7 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C2orf42Q9NWW7 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C2orf42Q9NWW7 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
C2orf42Q9NWW7 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C2orf42Q9NWW7 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C2orf42Q9NWW7 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C2orf42Q9NWW7 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
C2orf42Q9NWW7 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
C2orf42Q9NWW7 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
C2orf42Q9NWW7 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
C2orf42Q9NWW7 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
C2orf42Q9NWW7 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
C2orf42Q9NWW7 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
C2orf42Q9NWW7 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
C2orf42Q9NWW7 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C2orf42Q9NWW7 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C2orf42Q9NWW7 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
C2orf42Q9NWW7 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C2orf42Q9NWW7 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
C2orf42Q9NWW7 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
C2orf42Q9NWW7 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
C2orf42Q9NWW7 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
C2orf42Q9NWW7 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
C2orf42Q9NWW7 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C2orf42Q9NWW7 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
C2orf42Q9NWW7 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C2orf42Q9NWW7 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
C2orf42Q9NWW7 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C2orf42Q9NWW7 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
C2orf42Q9NWW7 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
C2orf42Q9NWW7 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C2orf42Q9NWW7 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C2orf42Q9NWW7 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
C2orf42Q9NWW7 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
C2orf42Q9NWW7 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C2orf42Q9NWW7 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C2orf42Q9NWW7 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C2orf42Q9NWW7 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C2orf42Q9NWW7 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
C2orf42Q9NWW7 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C2orf42Q9NWW7 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C2orf42Q9NWW7 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C2orf42Q9NWW7 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C2orf42Q9NWW7 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C2orf42Q9NWW7 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C2orf42Q9NWW7 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
C2orf42Q9NWW7 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
C2orf42Q9NWW7 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
C2orf42Q9NWW7 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
C2orf42Q9NWW7 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
C2orf42Q9NWW7 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
C2orf42Q9NWW7 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
C2orf42Q9NWW7 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
C2orf42Q9NWW7 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
C2orf42Q9NWW7 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
C2orf42Q9NWW7 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C2orf42Q9NWW7 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
C2orf42Q9NWW7 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
C2orf42Q9NWW7 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
C2orf42Q9NWW7 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
C2orf42Q9NWW7 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C2orf42Q9NWW7 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C2orf42Q9NWW7 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
C2orf42Q9NWW7 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C2orf42Q9NWW7 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C2orf42Q9NWW7 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
C2orf42Q9NWW7 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C2orf42Q9NWW7 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C2orf42Q9NWW7 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C2orf42Q9NWW7 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C2orf42Q9NWW7 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C2orf42Q9NWW7 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
C2orf42Q9NWW7 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C2orf42Q9NWW7 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
C2orf42Q9NWW7 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms