Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVW2

RLIM, E3 ubiquitin-protein ligase RLIM, humanhuman

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLIMQ9NVW2 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RLIMQ9NVW2 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RLIMQ9NVW2 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RLIMQ9NVW2 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RLIMQ9NVW2 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RLIMQ9NVW2 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RLIMQ9NVW2 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RLIMQ9NVW2 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RLIMQ9NVW2 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RLIMQ9NVW2 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RLIMQ9NVW2 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RLIMQ9NVW2 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RLIMQ9NVW2 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RLIMQ9NVW2 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RLIMQ9NVW2 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
RLIMQ9NVW2 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RLIMQ9NVW2 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RLIMQ9NVW2 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RLIMQ9NVW2 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RLIMQ9NVW2 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RLIMQ9NVW2 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RLIMQ9NVW2 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RLIMQ9NVW2 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RLIMQ9NVW2 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
RLIMQ9NVW2 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RLIMQ9NVW2 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
RLIMQ9NVW2 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RLIMQ9NVW2 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RLIMQ9NVW2 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RLIMQ9NVW2 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RLIMQ9NVW2 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RLIMQ9NVW2 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RLIMQ9NVW2 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RLIMQ9NVW2 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RLIMQ9NVW2 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RLIMQ9NVW2 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RLIMQ9NVW2 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RLIMQ9NVW2 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RLIMQ9NVW2 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RLIMQ9NVW2 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RLIMQ9NVW2 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RLIMQ9NVW2 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RLIMQ9NVW2 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RLIMQ9NVW2 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RLIMQ9NVW2 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RLIMQ9NVW2 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RLIMQ9NVW2 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
RLIMQ9NVW2 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RLIMQ9NVW2 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RLIMQ9NVW2 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RLIMQ9NVW2 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RLIMQ9NVW2 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
RLIMQ9NVW2 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
RLIMQ9NVW2 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RLIMQ9NVW2 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RLIMQ9NVW2 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RLIMQ9NVW2 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RLIMQ9NVW2 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
RLIMQ9NVW2 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RLIMQ9NVW2 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RLIMQ9NVW2 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RLIMQ9NVW2 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RLIMQ9NVW2 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RLIMQ9NVW2 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
RLIMQ9NVW2 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RLIMQ9NVW2 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RLIMQ9NVW2 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RLIMQ9NVW2 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RLIMQ9NVW2 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RLIMQ9NVW2 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RLIMQ9NVW2 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RLIMQ9NVW2 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RLIMQ9NVW2 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RLIMQ9NVW2 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RLIMQ9NVW2 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RLIMQ9NVW2 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RLIMQ9NVW2 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RLIMQ9NVW2 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
RLIMQ9NVW2 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
RLIMQ9NVW2 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RLIMQ9NVW2 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RLIMQ9NVW2 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
RLIMQ9NVW2 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RLIMQ9NVW2 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RLIMQ9NVW2 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RLIMQ9NVW2 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RLIMQ9NVW2 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RLIMQ9NVW2 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RLIMQ9NVW2 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RLIMQ9NVW2 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RLIMQ9NVW2 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RLIMQ9NVW2 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RLIMQ9NVW2 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RLIMQ9NVW2 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RLIMQ9NVW2 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RLIMQ9NVW2 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RLIMQ9NVW2 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RLIMQ9NVW2 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RLIMQ9NVW2 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RLIMQ9NVW2 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms