Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVP2

ASF1B, Histone chaperone ASF1B, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASF1BQ9NVP2 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ASF1BQ9NVP2 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ASF1BQ9NVP2 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ASF1BQ9NVP2 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ASF1BQ9NVP2 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ASF1BQ9NVP2 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ASF1BQ9NVP2 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ASF1BQ9NVP2 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ASF1BQ9NVP2 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ASF1BQ9NVP2 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ASF1BQ9NVP2 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ASF1BQ9NVP2 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ASF1BQ9NVP2 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ASF1BQ9NVP2 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ASF1BQ9NVP2 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ASF1BQ9NVP2 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ASF1BQ9NVP2 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ASF1BQ9NVP2 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ASF1BQ9NVP2 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ASF1BQ9NVP2 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ASF1BQ9NVP2 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ASF1BQ9NVP2 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ASF1BQ9NVP2 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ASF1BQ9NVP2 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ASF1BQ9NVP2 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ASF1BQ9NVP2 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ASF1BQ9NVP2 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ASF1BQ9NVP2 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ASF1BQ9NVP2 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ASF1BQ9NVP2 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ASF1BQ9NVP2 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ASF1BQ9NVP2 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ASF1BQ9NVP2 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ASF1BQ9NVP2 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ASF1BQ9NVP2 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ASF1BQ9NVP2 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ASF1BQ9NVP2 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ASF1BQ9NVP2 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ASF1BQ9NVP2 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ASF1BQ9NVP2 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ASF1BQ9NVP2 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ASF1BQ9NVP2 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ASF1BQ9NVP2 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ASF1BQ9NVP2 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ASF1BQ9NVP2 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ASF1BQ9NVP2 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ASF1BQ9NVP2 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ASF1BQ9NVP2 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ASF1BQ9NVP2 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ASF1BQ9NVP2 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ASF1BQ9NVP2 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ASF1BQ9NVP2 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ASF1BQ9NVP2 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ASF1BQ9NVP2 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ASF1BQ9NVP2 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ASF1BQ9NVP2 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ASF1BQ9NVP2 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ASF1BQ9NVP2 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ASF1BQ9NVP2 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
ASF1BQ9NVP2 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ASF1BQ9NVP2 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ASF1BQ9NVP2 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ASF1BQ9NVP2 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ASF1BQ9NVP2 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ASF1BQ9NVP2 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ASF1BQ9NVP2 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ASF1BQ9NVP2 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
ASF1BQ9NVP2 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ASF1BQ9NVP2 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ASF1BQ9NVP2 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ASF1BQ9NVP2 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ASF1BQ9NVP2 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ASF1BQ9NVP2 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ASF1BQ9NVP2 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
ASF1BQ9NVP2 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ASF1BQ9NVP2 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ASF1BQ9NVP2 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ASF1BQ9NVP2 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ASF1BQ9NVP2 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ASF1BQ9NVP2 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ASF1BQ9NVP2 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ASF1BQ9NVP2 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ASF1BQ9NVP2 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ASF1BQ9NVP2 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ASF1BQ9NVP2 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ASF1BQ9NVP2 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ASF1BQ9NVP2 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ASF1BQ9NVP2 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ASF1BQ9NVP2 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ASF1BQ9NVP2 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
ASF1BQ9NVP2 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ASF1BQ9NVP2 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ASF1BQ9NVP2 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ASF1BQ9NVP2 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ASF1BQ9NVP2 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ASF1BQ9NVP2 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ASF1BQ9NVP2 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ASF1BQ9NVP2 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ASF1BQ9NVP2 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ASF1BQ9NVP2 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms