Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTG1

PKDREJ, Polycystic kidney disease and receptor for egg jelly-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDREJQ9NTG1 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PKDREJQ9NTG1 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PKDREJQ9NTG1 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PKDREJQ9NTG1 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PKDREJQ9NTG1 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PKDREJQ9NTG1 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PKDREJQ9NTG1 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PKDREJQ9NTG1 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PKDREJQ9NTG1 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PKDREJQ9NTG1 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PKDREJQ9NTG1 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PKDREJQ9NTG1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PKDREJQ9NTG1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PKDREJQ9NTG1 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PKDREJQ9NTG1 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PKDREJQ9NTG1 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PKDREJQ9NTG1 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PKDREJQ9NTG1 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PKDREJQ9NTG1 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PKDREJQ9NTG1 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PKDREJQ9NTG1 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PKDREJQ9NTG1 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PKDREJQ9NTG1 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PKDREJQ9NTG1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PKDREJQ9NTG1 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PKDREJQ9NTG1 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PKDREJQ9NTG1 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PKDREJQ9NTG1 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PKDREJQ9NTG1 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PKDREJQ9NTG1 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PKDREJQ9NTG1 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PKDREJQ9NTG1 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PKDREJQ9NTG1 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PKDREJQ9NTG1 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PKDREJQ9NTG1 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PKDREJQ9NTG1 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PKDREJQ9NTG1 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PKDREJQ9NTG1 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PKDREJQ9NTG1 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
PKDREJQ9NTG1 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PKDREJQ9NTG1 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PKDREJQ9NTG1 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PKDREJQ9NTG1 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PKDREJQ9NTG1 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PKDREJQ9NTG1 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PKDREJQ9NTG1 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PKDREJQ9NTG1 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PKDREJQ9NTG1 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PKDREJQ9NTG1 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PKDREJQ9NTG1 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PKDREJQ9NTG1 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PKDREJQ9NTG1 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PKDREJQ9NTG1 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PKDREJQ9NTG1 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PKDREJQ9NTG1 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PKDREJQ9NTG1 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PKDREJQ9NTG1 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PKDREJQ9NTG1 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PKDREJQ9NTG1 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PKDREJQ9NTG1 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PKDREJQ9NTG1 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PKDREJQ9NTG1 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PKDREJQ9NTG1 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PKDREJQ9NTG1 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PKDREJQ9NTG1 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PKDREJQ9NTG1 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PKDREJQ9NTG1 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PKDREJQ9NTG1 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PKDREJQ9NTG1 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PKDREJQ9NTG1 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PKDREJQ9NTG1 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PKDREJQ9NTG1 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PKDREJQ9NTG1 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PKDREJQ9NTG1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PKDREJQ9NTG1 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PKDREJQ9NTG1 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PKDREJQ9NTG1 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PKDREJQ9NTG1 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PKDREJQ9NTG1 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PKDREJQ9NTG1 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PKDREJQ9NTG1 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PKDREJQ9NTG1 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PKDREJQ9NTG1 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PKDREJQ9NTG1 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
PKDREJQ9NTG1 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PKDREJQ9NTG1 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PKDREJQ9NTG1 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PKDREJQ9NTG1 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
PKDREJQ9NTG1 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PKDREJQ9NTG1 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PKDREJQ9NTG1 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PKDREJQ9NTG1 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PKDREJQ9NTG1 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
PKDREJQ9NTG1 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
PKDREJQ9NTG1 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PKDREJQ9NTG1 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PKDREJQ9NTG1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PKDREJQ9NTG1 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PKDREJQ9NTG1 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PKDREJQ9NTG1 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms