Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
ATG3Q9NT62 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
ATG3Q9NT62 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
ATG3Q9NT62 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
ATG3Q9NT62 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
ATG3Q9NT62 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
ATG3Q9NT62 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
ATG3Q9NT62 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
ATG3Q9NT62 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
ATG3Q9NT62 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
ATG3Q9NT62 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
ATG3Q9NT62 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
ATG3Q9NT62 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
ATG3Q9NT62 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
ATG3Q9NT62 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
ATG3Q9NT62 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
ATG3Q9NT62 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
ATG3Q9NT62 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
ATG3Q9NT62 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
ATG3Q9NT62 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
ATG3Q9NT62 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
ATG3Q9NT62 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
ATG3Q9NT62 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
ATG3Q9NT62 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
ATG3Q9NT62 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
ATG3Q9NT62 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
ATG3Q9NT62 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
ATG3Q9NT62 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
ATG3Q9NT62 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
ATG3Q9NT62 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
ATG3Q9NT62 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
ATG3Q9NT62 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
ATG3Q9NT62 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
ATG3Q9NT62 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
ATG3Q9NT62 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
ATG3Q9NT62 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
ATG3Q9NT62 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
ATG3Q9NT62 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
ATG3Q9NT62 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
ATG3Q9NT62 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
ATG3Q9NT62 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
ATG3Q9NT62 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
ATG3Q9NT62 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
ATG3Q9NT62 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
ATG3Q9NT62 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
ATG3Q9NT62 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
ATG3Q9NT62 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
ATG3Q9NT62 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
ATG3Q9NT62 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
ATG3Q9NT62 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
ATG3Q9NT62 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
ATG3Q9NT62 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
ATG3Q9NT62 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC30.09■■■□□ 2.41
ATG3Q9NT62 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
ATG3Q9NT62 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC30.08■■■□□ 2.41
ATG3Q9NT62 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
ATG3Q9NT62 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
ATG3Q9NT62 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
ATG3Q9NT62 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
ATG3Q9NT62 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
ATG3Q9NT62 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
ATG3Q9NT62 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
ATG3Q9NT62 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
ATG3Q9NT62 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
ATG3Q9NT62 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
ATG3Q9NT62 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
ATG3Q9NT62 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
ATG3Q9NT62 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
ATG3Q9NT62 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
ATG3Q9NT62 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
ATG3Q9NT62 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
ATG3Q9NT62 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
ATG3Q9NT62 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
ATG3Q9NT62 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
ATG3Q9NT62 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
ATG3Q9NT62 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
ATG3Q9NT62 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
ATG3Q9NT62 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
ATG3Q9NT62 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
ATG3Q9NT62 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
ATG3Q9NT62 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
ATG3Q9NT62 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
ATG3Q9NT62 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
ATG3Q9NT62 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
ATG3Q9NT62 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
ATG3Q9NT62 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
ATG3Q9NT62 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
ATG3Q9NT62 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
ATG3Q9NT62 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
ATG3Q9NT62 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
ATG3Q9NT62 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
ATG3Q9NT62 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
ATG3Q9NT62 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC30.02■■■□□ 2.4
ATG3Q9NT62 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
ATG3Q9NT62 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC30.02■■■□□ 2.4
ATG3Q9NT62 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
ATG3Q9NT62 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
ATG3Q9NT62 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.4
ATG3Q9NT62 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
ATG3Q9NT62 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms