Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCS2

CYP4F12, Cytochrome P450 4F12, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F12Q9HCS2 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CYP4F12Q9HCS2 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CYP4F12Q9HCS2 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CYP4F12Q9HCS2 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CYP4F12Q9HCS2 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CYP4F12Q9HCS2 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CYP4F12Q9HCS2 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CYP4F12Q9HCS2 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CYP4F12Q9HCS2 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CYP4F12Q9HCS2 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CYP4F12Q9HCS2 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CYP4F12Q9HCS2 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CYP4F12Q9HCS2 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CYP4F12Q9HCS2 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CYP4F12Q9HCS2 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CYP4F12Q9HCS2 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CYP4F12Q9HCS2 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CYP4F12Q9HCS2 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CYP4F12Q9HCS2 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CYP4F12Q9HCS2 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CYP4F12Q9HCS2 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CYP4F12Q9HCS2 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CYP4F12Q9HCS2 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CYP4F12Q9HCS2 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CYP4F12Q9HCS2 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CYP4F12Q9HCS2 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CYP4F12Q9HCS2 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CYP4F12Q9HCS2 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CYP4F12Q9HCS2 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CYP4F12Q9HCS2 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CYP4F12Q9HCS2 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CYP4F12Q9HCS2 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CYP4F12Q9HCS2 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CYP4F12Q9HCS2 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CYP4F12Q9HCS2 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CYP4F12Q9HCS2 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CYP4F12Q9HCS2 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CYP4F12Q9HCS2 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CYP4F12Q9HCS2 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CYP4F12Q9HCS2 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CYP4F12Q9HCS2 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CYP4F12Q9HCS2 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CYP4F12Q9HCS2 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CYP4F12Q9HCS2 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CYP4F12Q9HCS2 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CYP4F12Q9HCS2 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CYP4F12Q9HCS2 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CYP4F12Q9HCS2 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CYP4F12Q9HCS2 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CYP4F12Q9HCS2 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CYP4F12Q9HCS2 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CYP4F12Q9HCS2 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CYP4F12Q9HCS2 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CYP4F12Q9HCS2 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CYP4F12Q9HCS2 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CYP4F12Q9HCS2 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CYP4F12Q9HCS2 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CYP4F12Q9HCS2 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CYP4F12Q9HCS2 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CYP4F12Q9HCS2 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CYP4F12Q9HCS2 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CYP4F12Q9HCS2 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CYP4F12Q9HCS2 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CYP4F12Q9HCS2 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CYP4F12Q9HCS2 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CYP4F12Q9HCS2 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CYP4F12Q9HCS2 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CYP4F12Q9HCS2 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CYP4F12Q9HCS2 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CYP4F12Q9HCS2 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CYP4F12Q9HCS2 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CYP4F12Q9HCS2 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CYP4F12Q9HCS2 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CYP4F12Q9HCS2 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CYP4F12Q9HCS2 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
CYP4F12Q9HCS2 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CYP4F12Q9HCS2 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CYP4F12Q9HCS2 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CYP4F12Q9HCS2 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CYP4F12Q9HCS2 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CYP4F12Q9HCS2 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CYP4F12Q9HCS2 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CYP4F12Q9HCS2 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CYP4F12Q9HCS2 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CYP4F12Q9HCS2 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CYP4F12Q9HCS2 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CYP4F12Q9HCS2 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CYP4F12Q9HCS2 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CYP4F12Q9HCS2 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CYP4F12Q9HCS2 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CYP4F12Q9HCS2 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CYP4F12Q9HCS2 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CYP4F12Q9HCS2 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CYP4F12Q9HCS2 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CYP4F12Q9HCS2 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CYP4F12Q9HCS2 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CYP4F12Q9HCS2 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CYP4F12Q9HCS2 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CYP4F12Q9HCS2 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CYP4F12Q9HCS2 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms