Protein–RNA interactions for Protein: Q9H902

REEP1, Receptor expression-enhancing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REEP1Q9H902 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
REEP1Q9H902 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
REEP1Q9H902 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
REEP1Q9H902 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
REEP1Q9H902 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
REEP1Q9H902 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
REEP1Q9H902 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
REEP1Q9H902 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
REEP1Q9H902 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
REEP1Q9H902 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
REEP1Q9H902 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
REEP1Q9H902 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
REEP1Q9H902 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
REEP1Q9H902 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
REEP1Q9H902 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
REEP1Q9H902 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
REEP1Q9H902 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
REEP1Q9H902 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
REEP1Q9H902 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
REEP1Q9H902 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
REEP1Q9H902 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
REEP1Q9H902 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
REEP1Q9H902 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
REEP1Q9H902 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
REEP1Q9H902 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
REEP1Q9H902 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
REEP1Q9H902 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
REEP1Q9H902 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
REEP1Q9H902 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
REEP1Q9H902 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
REEP1Q9H902 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
REEP1Q9H902 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
REEP1Q9H902 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
REEP1Q9H902 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
REEP1Q9H902 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
REEP1Q9H902 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
REEP1Q9H902 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
REEP1Q9H902 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
REEP1Q9H902 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
REEP1Q9H902 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
REEP1Q9H902 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
REEP1Q9H902 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
REEP1Q9H902 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
REEP1Q9H902 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
REEP1Q9H902 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
REEP1Q9H902 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
REEP1Q9H902 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
REEP1Q9H902 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
REEP1Q9H902 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
REEP1Q9H902 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
REEP1Q9H902 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
REEP1Q9H902 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
REEP1Q9H902 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
REEP1Q9H902 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
REEP1Q9H902 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
REEP1Q9H902 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
REEP1Q9H902 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
REEP1Q9H902 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
REEP1Q9H902 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
REEP1Q9H902 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
REEP1Q9H902 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
REEP1Q9H902 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
REEP1Q9H902 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
REEP1Q9H902 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
REEP1Q9H902 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
REEP1Q9H902 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
REEP1Q9H902 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
REEP1Q9H902 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
REEP1Q9H902 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
REEP1Q9H902 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
REEP1Q9H902 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
REEP1Q9H902 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
REEP1Q9H902 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
REEP1Q9H902 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
REEP1Q9H902 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
REEP1Q9H902 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
REEP1Q9H902 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
REEP1Q9H902 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
REEP1Q9H902 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
REEP1Q9H902 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
REEP1Q9H902 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
REEP1Q9H902 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
REEP1Q9H902 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
REEP1Q9H902 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
REEP1Q9H902 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
REEP1Q9H902 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
REEP1Q9H902 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
REEP1Q9H902 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
REEP1Q9H902 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
REEP1Q9H902 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
REEP1Q9H902 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
REEP1Q9H902 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
REEP1Q9H902 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
REEP1Q9H902 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
REEP1Q9H902 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
REEP1Q9H902 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
REEP1Q9H902 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
REEP1Q9H902 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
REEP1Q9H902 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
REEP1Q9H902 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms