Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZY9

TRIM31, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM31, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM31Q9BZY9 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM31Q9BZY9 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM31Q9BZY9 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM31Q9BZY9 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM31Q9BZY9 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM31Q9BZY9 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM31Q9BZY9 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM31Q9BZY9 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM31Q9BZY9 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM31Q9BZY9 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM31Q9BZY9 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM31Q9BZY9 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM31Q9BZY9 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM31Q9BZY9 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM31Q9BZY9 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM31Q9BZY9 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM31Q9BZY9 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM31Q9BZY9 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM31Q9BZY9 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM31Q9BZY9 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM31Q9BZY9 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM31Q9BZY9 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM31Q9BZY9 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM31Q9BZY9 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM31Q9BZY9 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM31Q9BZY9 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM31Q9BZY9 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM31Q9BZY9 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM31Q9BZY9 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM31Q9BZY9 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM31Q9BZY9 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM31Q9BZY9 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM31Q9BZY9 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM31Q9BZY9 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM31Q9BZY9 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM31Q9BZY9 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM31Q9BZY9 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM31Q9BZY9 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM31Q9BZY9 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM31Q9BZY9 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM31Q9BZY9 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM31Q9BZY9 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM31Q9BZY9 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM31Q9BZY9 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM31Q9BZY9 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM31Q9BZY9 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM31Q9BZY9 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM31Q9BZY9 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM31Q9BZY9 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM31Q9BZY9 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM31Q9BZY9 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM31Q9BZY9 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM31Q9BZY9 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM31Q9BZY9 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM31Q9BZY9 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM31Q9BZY9 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM31Q9BZY9 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM31Q9BZY9 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM31Q9BZY9 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM31Q9BZY9 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM31Q9BZY9 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM31Q9BZY9 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM31Q9BZY9 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM31Q9BZY9 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM31Q9BZY9 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM31Q9BZY9 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM31Q9BZY9 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM31Q9BZY9 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM31Q9BZY9 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM31Q9BZY9 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM31Q9BZY9 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM31Q9BZY9 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM31Q9BZY9 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM31Q9BZY9 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM31Q9BZY9 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM31Q9BZY9 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM31Q9BZY9 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM31Q9BZY9 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM31Q9BZY9 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM31Q9BZY9 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM31Q9BZY9 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM31Q9BZY9 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM31Q9BZY9 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIM31Q9BZY9 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIM31Q9BZY9 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIM31Q9BZY9 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIM31Q9BZY9 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIM31Q9BZY9 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIM31Q9BZY9 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIM31Q9BZY9 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIM31Q9BZY9 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM31Q9BZY9 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM31Q9BZY9 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM31Q9BZY9 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM31Q9BZY9 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM31Q9BZY9 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM31Q9BZY9 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM31Q9BZY9 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM31Q9BZY9 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TRIM31Q9BZY9 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.2 ms