Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT4

TDRD1, Tudor domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD1Q9BXT4 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TDRD1Q9BXT4 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TDRD1Q9BXT4 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TDRD1Q9BXT4 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TDRD1Q9BXT4 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TDRD1Q9BXT4 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TDRD1Q9BXT4 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TDRD1Q9BXT4 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TDRD1Q9BXT4 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TDRD1Q9BXT4 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TDRD1Q9BXT4 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TDRD1Q9BXT4 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TDRD1Q9BXT4 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TDRD1Q9BXT4 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TDRD1Q9BXT4 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TDRD1Q9BXT4 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TDRD1Q9BXT4 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TDRD1Q9BXT4 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TDRD1Q9BXT4 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TDRD1Q9BXT4 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TDRD1Q9BXT4 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TDRD1Q9BXT4 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TDRD1Q9BXT4 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TDRD1Q9BXT4 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TDRD1Q9BXT4 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TDRD1Q9BXT4 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TDRD1Q9BXT4 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TDRD1Q9BXT4 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TDRD1Q9BXT4 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TDRD1Q9BXT4 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TDRD1Q9BXT4 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TDRD1Q9BXT4 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TDRD1Q9BXT4 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TDRD1Q9BXT4 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TDRD1Q9BXT4 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TDRD1Q9BXT4 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TDRD1Q9BXT4 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TDRD1Q9BXT4 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TDRD1Q9BXT4 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TDRD1Q9BXT4 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TDRD1Q9BXT4 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TDRD1Q9BXT4 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TDRD1Q9BXT4 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TDRD1Q9BXT4 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TDRD1Q9BXT4 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TDRD1Q9BXT4 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TDRD1Q9BXT4 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TDRD1Q9BXT4 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TDRD1Q9BXT4 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TDRD1Q9BXT4 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TDRD1Q9BXT4 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TDRD1Q9BXT4 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TDRD1Q9BXT4 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TDRD1Q9BXT4 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TDRD1Q9BXT4 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TDRD1Q9BXT4 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TDRD1Q9BXT4 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TDRD1Q9BXT4 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TDRD1Q9BXT4 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TDRD1Q9BXT4 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TDRD1Q9BXT4 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TDRD1Q9BXT4 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TDRD1Q9BXT4 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TDRD1Q9BXT4 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TDRD1Q9BXT4 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TDRD1Q9BXT4 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TDRD1Q9BXT4 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TDRD1Q9BXT4 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TDRD1Q9BXT4 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TDRD1Q9BXT4 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TDRD1Q9BXT4 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
TDRD1Q9BXT4 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TDRD1Q9BXT4 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TDRD1Q9BXT4 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TDRD1Q9BXT4 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TDRD1Q9BXT4 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TDRD1Q9BXT4 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TDRD1Q9BXT4 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TDRD1Q9BXT4 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TDRD1Q9BXT4 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TDRD1Q9BXT4 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TDRD1Q9BXT4 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TDRD1Q9BXT4 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TDRD1Q9BXT4 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TDRD1Q9BXT4 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TDRD1Q9BXT4 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TDRD1Q9BXT4 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TDRD1Q9BXT4 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TDRD1Q9BXT4 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TDRD1Q9BXT4 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TDRD1Q9BXT4 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TDRD1Q9BXT4 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TDRD1Q9BXT4 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TDRD1Q9BXT4 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TDRD1Q9BXT4 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TDRD1Q9BXT4 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TDRD1Q9BXT4 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TDRD1Q9BXT4 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TDRD1Q9BXT4 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TDRD1Q9BXT4 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms