Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWQ6

YIPF2, Protein YIPF2, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YIPF2Q9BWQ6 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
YIPF2Q9BWQ6 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
YIPF2Q9BWQ6 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
YIPF2Q9BWQ6 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
YIPF2Q9BWQ6 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
YIPF2Q9BWQ6 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
YIPF2Q9BWQ6 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
YIPF2Q9BWQ6 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
YIPF2Q9BWQ6 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
YIPF2Q9BWQ6 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
YIPF2Q9BWQ6 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
YIPF2Q9BWQ6 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
YIPF2Q9BWQ6 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
YIPF2Q9BWQ6 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
YIPF2Q9BWQ6 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
YIPF2Q9BWQ6 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
YIPF2Q9BWQ6 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
YIPF2Q9BWQ6 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
YIPF2Q9BWQ6 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
YIPF2Q9BWQ6 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
YIPF2Q9BWQ6 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
YIPF2Q9BWQ6 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
YIPF2Q9BWQ6 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
YIPF2Q9BWQ6 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
YIPF2Q9BWQ6 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
YIPF2Q9BWQ6 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
YIPF2Q9BWQ6 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
YIPF2Q9BWQ6 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
YIPF2Q9BWQ6 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
YIPF2Q9BWQ6 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
YIPF2Q9BWQ6 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
YIPF2Q9BWQ6 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
YIPF2Q9BWQ6 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
YIPF2Q9BWQ6 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
YIPF2Q9BWQ6 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
YIPF2Q9BWQ6 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
YIPF2Q9BWQ6 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
YIPF2Q9BWQ6 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
YIPF2Q9BWQ6 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
YIPF2Q9BWQ6 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
YIPF2Q9BWQ6 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
YIPF2Q9BWQ6 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
YIPF2Q9BWQ6 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
YIPF2Q9BWQ6 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
YIPF2Q9BWQ6 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
YIPF2Q9BWQ6 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
YIPF2Q9BWQ6 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
YIPF2Q9BWQ6 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
YIPF2Q9BWQ6 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
YIPF2Q9BWQ6 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
YIPF2Q9BWQ6 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
YIPF2Q9BWQ6 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
YIPF2Q9BWQ6 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
YIPF2Q9BWQ6 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
YIPF2Q9BWQ6 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
YIPF2Q9BWQ6 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
YIPF2Q9BWQ6 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
YIPF2Q9BWQ6 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
YIPF2Q9BWQ6 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
YIPF2Q9BWQ6 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
YIPF2Q9BWQ6 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
YIPF2Q9BWQ6 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
YIPF2Q9BWQ6 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
YIPF2Q9BWQ6 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
YIPF2Q9BWQ6 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
YIPF2Q9BWQ6 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
YIPF2Q9BWQ6 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
YIPF2Q9BWQ6 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
YIPF2Q9BWQ6 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
YIPF2Q9BWQ6 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
YIPF2Q9BWQ6 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
YIPF2Q9BWQ6 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
YIPF2Q9BWQ6 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
YIPF2Q9BWQ6 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
YIPF2Q9BWQ6 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
YIPF2Q9BWQ6 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
YIPF2Q9BWQ6 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
YIPF2Q9BWQ6 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
YIPF2Q9BWQ6 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
YIPF2Q9BWQ6 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
YIPF2Q9BWQ6 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
YIPF2Q9BWQ6 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
YIPF2Q9BWQ6 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
YIPF2Q9BWQ6 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
YIPF2Q9BWQ6 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
YIPF2Q9BWQ6 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
YIPF2Q9BWQ6 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
YIPF2Q9BWQ6 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
YIPF2Q9BWQ6 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
YIPF2Q9BWQ6 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
YIPF2Q9BWQ6 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
YIPF2Q9BWQ6 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
YIPF2Q9BWQ6 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
YIPF2Q9BWQ6 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
YIPF2Q9BWQ6 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
YIPF2Q9BWQ6 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
YIPF2Q9BWQ6 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
YIPF2Q9BWQ6 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
YIPF2Q9BWQ6 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
YIPF2Q9BWQ6 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms