Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA1

TUBB2B, Tubulin beta-2B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB2BQ9BVA1 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TUBB2BQ9BVA1 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TUBB2BQ9BVA1 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TUBB2BQ9BVA1 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TUBB2BQ9BVA1 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TUBB2BQ9BVA1 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TUBB2BQ9BVA1 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TUBB2BQ9BVA1 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TUBB2BQ9BVA1 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TUBB2BQ9BVA1 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TUBB2BQ9BVA1 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TUBB2BQ9BVA1 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TUBB2BQ9BVA1 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TUBB2BQ9BVA1 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TUBB2BQ9BVA1 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TUBB2BQ9BVA1 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TUBB2BQ9BVA1 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TUBB2BQ9BVA1 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TUBB2BQ9BVA1 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TUBB2BQ9BVA1 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TUBB2BQ9BVA1 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TUBB2BQ9BVA1 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TUBB2BQ9BVA1 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TUBB2BQ9BVA1 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TUBB2BQ9BVA1 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TUBB2BQ9BVA1 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TUBB2BQ9BVA1 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TUBB2BQ9BVA1 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TUBB2BQ9BVA1 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TUBB2BQ9BVA1 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TUBB2BQ9BVA1 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TUBB2BQ9BVA1 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TUBB2BQ9BVA1 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TUBB2BQ9BVA1 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TUBB2BQ9BVA1 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TUBB2BQ9BVA1 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TUBB2BQ9BVA1 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TUBB2BQ9BVA1 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TUBB2BQ9BVA1 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TUBB2BQ9BVA1 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TUBB2BQ9BVA1 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TUBB2BQ9BVA1 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TUBB2BQ9BVA1 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TUBB2BQ9BVA1 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TUBB2BQ9BVA1 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TUBB2BQ9BVA1 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TUBB2BQ9BVA1 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
TUBB2BQ9BVA1 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TUBB2BQ9BVA1 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TUBB2BQ9BVA1 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TUBB2BQ9BVA1 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TUBB2BQ9BVA1 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TUBB2BQ9BVA1 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TUBB2BQ9BVA1 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TUBB2BQ9BVA1 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TUBB2BQ9BVA1 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TUBB2BQ9BVA1 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TUBB2BQ9BVA1 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TUBB2BQ9BVA1 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TUBB2BQ9BVA1 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TUBB2BQ9BVA1 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TUBB2BQ9BVA1 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TUBB2BQ9BVA1 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TUBB2BQ9BVA1 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TUBB2BQ9BVA1 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TUBB2BQ9BVA1 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TUBB2BQ9BVA1 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TUBB2BQ9BVA1 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TUBB2BQ9BVA1 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TUBB2BQ9BVA1 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TUBB2BQ9BVA1 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TUBB2BQ9BVA1 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TUBB2BQ9BVA1 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TUBB2BQ9BVA1 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TUBB2BQ9BVA1 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TUBB2BQ9BVA1 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TUBB2BQ9BVA1 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TUBB2BQ9BVA1 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TUBB2BQ9BVA1 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TUBB2BQ9BVA1 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TUBB2BQ9BVA1 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TUBB2BQ9BVA1 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TUBB2BQ9BVA1 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TUBB2BQ9BVA1 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TUBB2BQ9BVA1 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TUBB2BQ9BVA1 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TUBB2BQ9BVA1 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TUBB2BQ9BVA1 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
TUBB2BQ9BVA1 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TUBB2BQ9BVA1 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
TUBB2BQ9BVA1 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TUBB2BQ9BVA1 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TUBB2BQ9BVA1 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TUBB2BQ9BVA1 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TUBB2BQ9BVA1 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TUBB2BQ9BVA1 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TUBB2BQ9BVA1 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TUBB2BQ9BVA1 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TUBB2BQ9BVA1 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TUBB2BQ9BVA1 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms