Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRD0

BUD13, BUD13 homolog, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 619 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BUD13Q9BRD0 TTLL12-203ENST00000484711 2451 ntTSL 217.16■□□□□ 0.342e-6■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.333e-6■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.313e-6■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.33e-6■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 ITPR1-217ENST00000493491 1793 ntTSL 216.92■□□□□ 0.33e-6■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 POLR2E-203ENST00000586215 756 ntTSL 216.89■□□□□ 0.293e-6■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 SNX13-204ENST00000444712 2018 ntTSL 516.8■□□□□ 0.283e-6■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.273e-6■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 GTF2F1-206ENST00000598607 568 ntTSL 416.74■□□□□ 0.273e-6■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 LINC02001-201ENST00000592381 1298 ntTSL 216.71■□□□□ 0.273e-6■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.261e-11■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 TOMM40L-204ENST00000468803 424 ntTSL 216.66■□□□□ 0.263e-6■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.243e-6■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 XAB2-202ENST00000595288 4555 ntTSL 216.57■□□□□ 0.242e-6■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.233e-6■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.213e-6■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 POM121C-203ENST00000473168 549 ntTSL 416.32■□□□□ 0.23e-6■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 CALCOCO1-203ENST00000546443 1523 ntTSL 1 (best)16.3■□□□□ 0.23e-6■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 SRP68-205ENST00000586859 703 ntTSL 316.28■□□□□ 0.23e-6■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 TOMM40L-206ENST00000474486 2396 ntTSL 216.27■□□□□ 0.193e-6■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 KCTD10-205ENST00000537165 2940 ntTSL 216.25■□□□□ 0.193e-6■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 ACBD5-208ENST00000476758 1645 ntTSL 216.21■□□□□ 0.193e-6■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.143e-6■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.142e-7■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 KATNB1-207ENST00000566726 728 ntTSL 315.86■□□□□ 0.133e-6■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 POM121C-205ENST00000479864 423 ntTSL 315.82■□□□□ 0.123e-6■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 SMUG1-210ENST00000505597 494 ntTSL 515.8■□□□□ 0.123e-6■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 GTF2F1-202ENST00000593678 1705 ntTSL 215.72■□□□□ 0.113e-8■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 CCDC88C-202ENST00000334448 1055 ntTSL 1 (best)15.69■□□□□ 0.13e-6■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 PDCD11-206ENST00000493610 732 ntTSL 515.63■□□□□ 0.093e-6■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.093e-6■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 TOMM40L-208ENST00000492482 1120 ntTSL 315.61■□□□□ 0.093e-6■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 ELMO3-205ENST00000571638 681 ntTSL 515.59■□□□□ 0.093e-6■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.072e-6■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 CC2D1B-207ENST00000470844 728 ntTSL 515.36■□□□□ 0.051e-11■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 DEGS1-203ENST00000415210 957 ntTSL 515.27■□□□□ 0.043e-6■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.013e-6■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 ABCA2-212ENST00000464876 3438 ntTSL 215.1■□□□□ 0.017e-9■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -03e-6■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 TNFRSF10A-204ENST00000613472 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.033e-6■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 TOMM40L-209ENST00000545897 2807 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.053e-6■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 CCDC88C-201ENST00000331194 3104 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.063e-6■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 GTF2F1-201ENST00000394456 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.073e-8■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 DEGS1-202ENST00000391877 1345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.093e-6■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 TUBGCP4-201ENST00000260383 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.093e-6■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 ITPR1-208ENST00000467545 571 ntTSL 414.33□□□□□ -0.123e-6■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 C2CD2-208ENST00000490479 761 ntTSL 314.32□□□□□ -0.122e-6■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 ZNF799-202ENST00000430385 2583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.133e-6■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 FBF1-202ENST00000585990 4481 ntTSL 214.16□□□□□ -0.145e-7■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 SFXN3-207ENST00000489434 744 ntTSL 314.12□□□□□ -0.153e-6■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 KCTD10-201ENST00000228495 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.173e-6■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 DGKE-201ENST00000284061 8660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.183e-6■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 AP003108.3-201ENST00000623765 2234 ntBASIC13.94□□□□□ -0.183e-6■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 HDGFL2-205ENST00000601353 648 ntTSL 513.92□□□□□ -0.183e-6■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 LMBR1L-218ENST00000551143 578 ntTSL 313.86□□□□□ -0.192e-6■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 GIT1-214ENST00000585148 686 ntTSL 313.86□□□□□ -0.193e-6■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 TOMM40L-205ENST00000470426 845 ntTSL 513.83□□□□□ -0.23e-6■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 ZNF558-205ENST00000597304 2612 ntTSL 513.78□□□□□ -0.23e-7■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 CEP164-206ENST00000529153 575 ntTSL 413.69□□□□□ -0.223e-6■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 XAB2-201ENST00000358368 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.222e-6■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 ZBTB14-204ENST00000582135 649 ntTSL 213.63□□□□□ -0.233e-6■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 FBF1-210ENST00000592193 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.245e-7■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 ACBD5-205ENST00000396271 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.253e-6■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 SRP68-212ENST00000602720 2037 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.263e-6■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 ASB7-201ENST00000332783 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.263e-6■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 SIPA1L1-218ENST00000557712 1823 ntTSL 213.39□□□□□ -0.273e-6■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 ZNF544-219ENST00000602260 552 ntTSL 413.38□□□□□ -0.273e-6■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 KRBA1-206ENST00000496080 654 ntTSL 313.38□□□□□ -0.273e-6■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 GIT1-212ENST00000581925 610 ntTSL 413.35□□□□□ -0.273e-6■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 ZNF544-211ENST00000597564 480 ntTSL 313.26□□□□□ -0.293e-6■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 ITPR1-206ENST00000463980 2215 ntTSL 213.23□□□□□ -0.293e-6■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 BORCS7-201ENST00000339834 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.33e-6■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 CCDC88C-211ENST00000556726 3617 ntTSL 513.14□□□□□ -0.313e-6■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 FBF1-201ENST00000319129 4156 ntAPPRIS ALT2 TSL 513.1□□□□□ -0.315e-7■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 AC008758.4-201ENST00000435033 2593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.333e-6■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 TOMM40L-202ENST00000367988 2708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.333e-6■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 GIT1-215ENST00000586574 576 ntTSL 412.83□□□□□ -0.363e-6■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 FBF1-212ENST00000636174 3626 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.365e-7■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 SRP68-203ENST00000542536 1714 ntTSL 212.74□□□□□ -0.373e-6■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 TUBGCP4-208ENST00000564079 6798 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.383e-6■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 GIT1-204ENST00000473217 3462 ntTSL 1 (best)12.68□□□□□ -0.383e-6■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 ZBTB14-208ENST00000615385 3350 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.383e-6■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 IER3IP1-201ENST00000256433 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.43e-6■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 MAMSTR-205ENST00000599703 714 ntTSL 512.52□□□□□ -0.413e-6■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 DEPDC5-216ENST00000473802 503 ntTSL 312.46□□□□□ -0.413e-6■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 MIS18BP1-201ENST00000310806 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.423e-6■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 ACBD5-203ENST00000375901 3685 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.423e-6■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 EML3-214ENST00000524518 514 ntTSL 312.41□□□□□ -0.423e-6■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 CCDC115-204ENST00000465315 3562 ntTSL 212.4□□□□□ -0.423e-6■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 LMBR1L-229ENST00000553040 768 ntTSL 512.35□□□□□ -0.437e-7■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 EIF3D-202ENST00000402116 581 ntTSL 312.32□□□□□ -0.442e-12■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 EXO1-206ENST00000469419 754 ntTSL 312.01□□□□□ -0.498e-7■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 LINC02001-202ENST00000638682 1504 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.493e-6■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 ZNF558-201ENST00000301475 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.513e-7■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 ZNF558-207ENST00000601372 7032 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.523e-7■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 KCTD10-213ENST00000542262 554 ntTSL 411.59□□□□□ -0.553e-6■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 EXO1-207ENST00000493702 783 ntTSL 511.48□□□□□ -0.578e-7■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 KCTD10-204ENST00000535747 735 ntTSL 211.34□□□□□ -0.593e-6■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 RRP12-207ENST00000479481 3271 ntTSL 1 (best)11.33□□□□□ -0.63e-6■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 CEMIP-206ENST00000560027 648 ntTSL 211.28□□□□□ -0.63e-6■■■■■ 30.2
Retrieved 100 of 53,381 protein–RNA pairs in 5328.9 ms