Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQA5

HINFP, Histone H4 transcription factor, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HINFPQ9BQA5 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HINFPQ9BQA5 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HINFPQ9BQA5 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HINFPQ9BQA5 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HINFPQ9BQA5 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HINFPQ9BQA5 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HINFPQ9BQA5 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HINFPQ9BQA5 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HINFPQ9BQA5 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HINFPQ9BQA5 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HINFPQ9BQA5 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HINFPQ9BQA5 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HINFPQ9BQA5 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HINFPQ9BQA5 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HINFPQ9BQA5 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HINFPQ9BQA5 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HINFPQ9BQA5 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HINFPQ9BQA5 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HINFPQ9BQA5 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HINFPQ9BQA5 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HINFPQ9BQA5 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HINFPQ9BQA5 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HINFPQ9BQA5 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HINFPQ9BQA5 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HINFPQ9BQA5 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HINFPQ9BQA5 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HINFPQ9BQA5 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HINFPQ9BQA5 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HINFPQ9BQA5 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HINFPQ9BQA5 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HINFPQ9BQA5 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HINFPQ9BQA5 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
HINFPQ9BQA5 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
HINFPQ9BQA5 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HINFPQ9BQA5 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HINFPQ9BQA5 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HINFPQ9BQA5 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HINFPQ9BQA5 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HINFPQ9BQA5 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HINFPQ9BQA5 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HINFPQ9BQA5 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HINFPQ9BQA5 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HINFPQ9BQA5 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HINFPQ9BQA5 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HINFPQ9BQA5 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HINFPQ9BQA5 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HINFPQ9BQA5 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HINFPQ9BQA5 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HINFPQ9BQA5 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HINFPQ9BQA5 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HINFPQ9BQA5 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HINFPQ9BQA5 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HINFPQ9BQA5 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HINFPQ9BQA5 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HINFPQ9BQA5 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
HINFPQ9BQA5 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HINFPQ9BQA5 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HINFPQ9BQA5 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HINFPQ9BQA5 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HINFPQ9BQA5 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HINFPQ9BQA5 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HINFPQ9BQA5 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HINFPQ9BQA5 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HINFPQ9BQA5 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HINFPQ9BQA5 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HINFPQ9BQA5 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HINFPQ9BQA5 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
HINFPQ9BQA5 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HINFPQ9BQA5 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
HINFPQ9BQA5 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HINFPQ9BQA5 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HINFPQ9BQA5 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
HINFPQ9BQA5 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HINFPQ9BQA5 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HINFPQ9BQA5 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
HINFPQ9BQA5 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
HINFPQ9BQA5 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HINFPQ9BQA5 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HINFPQ9BQA5 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HINFPQ9BQA5 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HINFPQ9BQA5 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HINFPQ9BQA5 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HINFPQ9BQA5 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HINFPQ9BQA5 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HINFPQ9BQA5 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HINFPQ9BQA5 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HINFPQ9BQA5 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HINFPQ9BQA5 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HINFPQ9BQA5 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HINFPQ9BQA5 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HINFPQ9BQA5 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HINFPQ9BQA5 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HINFPQ9BQA5 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HINFPQ9BQA5 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HINFPQ9BQA5 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HINFPQ9BQA5 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HINFPQ9BQA5 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HINFPQ9BQA5 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HINFPQ9BQA5 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HINFPQ9BQA5 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms