Protein–RNA interactions for Protein: Q96T83

SLC9A7, Sodium/hydrogen exchanger 7, humanhuman

Predictions only

Length 725 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A7Q96T83 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC9A7Q96T83 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC9A7Q96T83 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC9A7Q96T83 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC9A7Q96T83 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC9A7Q96T83 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC9A7Q96T83 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC9A7Q96T83 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC9A7Q96T83 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC9A7Q96T83 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC9A7Q96T83 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC9A7Q96T83 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC9A7Q96T83 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC9A7Q96T83 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC9A7Q96T83 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC9A7Q96T83 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC9A7Q96T83 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC9A7Q96T83 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC9A7Q96T83 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC9A7Q96T83 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC9A7Q96T83 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC9A7Q96T83 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC9A7Q96T83 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC9A7Q96T83 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC9A7Q96T83 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC9A7Q96T83 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC9A7Q96T83 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC9A7Q96T83 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC9A7Q96T83 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC9A7Q96T83 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC9A7Q96T83 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC9A7Q96T83 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC9A7Q96T83 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC9A7Q96T83 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC9A7Q96T83 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC9A7Q96T83 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC9A7Q96T83 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC9A7Q96T83 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC9A7Q96T83 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC9A7Q96T83 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC9A7Q96T83 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC9A7Q96T83 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC9A7Q96T83 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC9A7Q96T83 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC9A7Q96T83 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC9A7Q96T83 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC9A7Q96T83 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC9A7Q96T83 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC9A7Q96T83 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC9A7Q96T83 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC9A7Q96T83 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC9A7Q96T83 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC9A7Q96T83 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC9A7Q96T83 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC9A7Q96T83 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC9A7Q96T83 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
SLC9A7Q96T83 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SLC9A7Q96T83 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC9A7Q96T83 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC9A7Q96T83 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC9A7Q96T83 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC9A7Q96T83 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC9A7Q96T83 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC9A7Q96T83 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC9A7Q96T83 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC9A7Q96T83 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC9A7Q96T83 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC9A7Q96T83 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC9A7Q96T83 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC9A7Q96T83 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC9A7Q96T83 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC9A7Q96T83 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC9A7Q96T83 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC9A7Q96T83 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC9A7Q96T83 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC9A7Q96T83 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC9A7Q96T83 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC9A7Q96T83 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC9A7Q96T83 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC9A7Q96T83 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC9A7Q96T83 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC9A7Q96T83 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC9A7Q96T83 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC9A7Q96T83 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC9A7Q96T83 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC9A7Q96T83 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC9A7Q96T83 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC9A7Q96T83 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC9A7Q96T83 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC9A7Q96T83 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC9A7Q96T83 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC9A7Q96T83 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC9A7Q96T83 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC9A7Q96T83 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC9A7Q96T83 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC9A7Q96T83 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC9A7Q96T83 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC9A7Q96T83 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
SLC9A7Q96T83 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
SLC9A7Q96T83 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms