Protein–RNA interactions for Protein: Q96S82

UBL7, Ubiquitin-like protein 7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 380 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBL7Q96S82 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBL7Q96S82 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBL7Q96S82 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBL7Q96S82 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBL7Q96S82 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBL7Q96S82 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBL7Q96S82 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBL7Q96S82 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBL7Q96S82 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBL7Q96S82 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBL7Q96S82 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBL7Q96S82 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBL7Q96S82 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBL7Q96S82 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBL7Q96S82 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBL7Q96S82 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBL7Q96S82 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBL7Q96S82 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
UBL7Q96S82 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBL7Q96S82 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBL7Q96S82 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBL7Q96S82 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBL7Q96S82 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBL7Q96S82 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBL7Q96S82 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBL7Q96S82 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBL7Q96S82 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBL7Q96S82 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBL7Q96S82 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBL7Q96S82 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBL7Q96S82 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBL7Q96S82 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBL7Q96S82 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBL7Q96S82 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBL7Q96S82 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBL7Q96S82 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
UBL7Q96S82 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBL7Q96S82 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBL7Q96S82 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBL7Q96S82 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBL7Q96S82 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBL7Q96S82 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBL7Q96S82 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBL7Q96S82 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
UBL7Q96S82 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
UBL7Q96S82 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
UBL7Q96S82 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
UBL7Q96S82 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
UBL7Q96S82 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBL7Q96S82 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBL7Q96S82 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
UBL7Q96S82 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBL7Q96S82 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBL7Q96S82 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBL7Q96S82 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBL7Q96S82 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBL7Q96S82 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBL7Q96S82 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBL7Q96S82 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBL7Q96S82 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBL7Q96S82 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
UBL7Q96S82 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBL7Q96S82 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBL7Q96S82 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBL7Q96S82 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBL7Q96S82 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBL7Q96S82 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBL7Q96S82 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBL7Q96S82 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBL7Q96S82 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBL7Q96S82 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBL7Q96S82 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBL7Q96S82 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBL7Q96S82 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
UBL7Q96S82 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBL7Q96S82 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBL7Q96S82 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBL7Q96S82 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBL7Q96S82 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBL7Q96S82 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBL7Q96S82 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBL7Q96S82 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBL7Q96S82 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBL7Q96S82 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBL7Q96S82 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBL7Q96S82 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBL7Q96S82 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBL7Q96S82 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBL7Q96S82 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBL7Q96S82 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBL7Q96S82 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
UBL7Q96S82 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBL7Q96S82 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBL7Q96S82 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBL7Q96S82 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBL7Q96S82 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBL7Q96S82 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
UBL7Q96S82 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBL7Q96S82 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBL7Q96S82 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms