Protein–RNA interactions for Protein: Q96KX2

CAPZA3, F-actin-capping protein subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPZA3Q96KX2 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CAPZA3Q96KX2 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CAPZA3Q96KX2 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CAPZA3Q96KX2 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CAPZA3Q96KX2 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CAPZA3Q96KX2 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CAPZA3Q96KX2 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CAPZA3Q96KX2 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CAPZA3Q96KX2 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CAPZA3Q96KX2 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CAPZA3Q96KX2 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CAPZA3Q96KX2 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CAPZA3Q96KX2 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CAPZA3Q96KX2 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CAPZA3Q96KX2 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CAPZA3Q96KX2 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CAPZA3Q96KX2 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CAPZA3Q96KX2 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CAPZA3Q96KX2 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CAPZA3Q96KX2 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CAPZA3Q96KX2 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CAPZA3Q96KX2 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CAPZA3Q96KX2 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CAPZA3Q96KX2 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CAPZA3Q96KX2 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CAPZA3Q96KX2 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CAPZA3Q96KX2 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CAPZA3Q96KX2 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CAPZA3Q96KX2 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CAPZA3Q96KX2 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CAPZA3Q96KX2 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CAPZA3Q96KX2 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CAPZA3Q96KX2 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CAPZA3Q96KX2 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CAPZA3Q96KX2 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CAPZA3Q96KX2 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CAPZA3Q96KX2 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CAPZA3Q96KX2 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CAPZA3Q96KX2 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CAPZA3Q96KX2 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CAPZA3Q96KX2 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CAPZA3Q96KX2 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CAPZA3Q96KX2 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CAPZA3Q96KX2 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CAPZA3Q96KX2 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CAPZA3Q96KX2 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CAPZA3Q96KX2 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CAPZA3Q96KX2 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CAPZA3Q96KX2 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CAPZA3Q96KX2 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CAPZA3Q96KX2 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CAPZA3Q96KX2 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CAPZA3Q96KX2 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CAPZA3Q96KX2 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CAPZA3Q96KX2 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CAPZA3Q96KX2 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CAPZA3Q96KX2 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CAPZA3Q96KX2 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CAPZA3Q96KX2 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CAPZA3Q96KX2 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CAPZA3Q96KX2 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CAPZA3Q96KX2 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CAPZA3Q96KX2 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CAPZA3Q96KX2 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CAPZA3Q96KX2 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CAPZA3Q96KX2 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CAPZA3Q96KX2 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CAPZA3Q96KX2 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CAPZA3Q96KX2 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CAPZA3Q96KX2 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CAPZA3Q96KX2 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CAPZA3Q96KX2 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CAPZA3Q96KX2 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CAPZA3Q96KX2 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CAPZA3Q96KX2 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CAPZA3Q96KX2 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CAPZA3Q96KX2 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CAPZA3Q96KX2 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CAPZA3Q96KX2 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CAPZA3Q96KX2 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CAPZA3Q96KX2 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CAPZA3Q96KX2 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
CAPZA3Q96KX2 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CAPZA3Q96KX2 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CAPZA3Q96KX2 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CAPZA3Q96KX2 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CAPZA3Q96KX2 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CAPZA3Q96KX2 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CAPZA3Q96KX2 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CAPZA3Q96KX2 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CAPZA3Q96KX2 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CAPZA3Q96KX2 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CAPZA3Q96KX2 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CAPZA3Q96KX2 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CAPZA3Q96KX2 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CAPZA3Q96KX2 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CAPZA3Q96KX2 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CAPZA3Q96KX2 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CAPZA3Q96KX2 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CAPZA3Q96KX2 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 164.9 ms