Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN7

RPGRIP1, X-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPGRIP1Q96KN7 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RPGRIP1Q96KN7 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RPGRIP1Q96KN7 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RPGRIP1Q96KN7 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RPGRIP1Q96KN7 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RPGRIP1Q96KN7 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RPGRIP1Q96KN7 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RPGRIP1Q96KN7 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RPGRIP1Q96KN7 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
RPGRIP1Q96KN7 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
RPGRIP1Q96KN7 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RPGRIP1Q96KN7 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RPGRIP1Q96KN7 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RPGRIP1Q96KN7 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RPGRIP1Q96KN7 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
RPGRIP1Q96KN7 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RPGRIP1Q96KN7 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RPGRIP1Q96KN7 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RPGRIP1Q96KN7 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RPGRIP1Q96KN7 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RPGRIP1Q96KN7 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RPGRIP1Q96KN7 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
RPGRIP1Q96KN7 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
RPGRIP1Q96KN7 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RPGRIP1Q96KN7 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RPGRIP1Q96KN7 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RPGRIP1Q96KN7 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RPGRIP1Q96KN7 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RPGRIP1Q96KN7 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RPGRIP1Q96KN7 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RPGRIP1Q96KN7 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RPGRIP1Q96KN7 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RPGRIP1Q96KN7 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RPGRIP1Q96KN7 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RPGRIP1Q96KN7 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RPGRIP1Q96KN7 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RPGRIP1Q96KN7 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RPGRIP1Q96KN7 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RPGRIP1Q96KN7 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RPGRIP1Q96KN7 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RPGRIP1Q96KN7 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RPGRIP1Q96KN7 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RPGRIP1Q96KN7 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RPGRIP1Q96KN7 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RPGRIP1Q96KN7 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RPGRIP1Q96KN7 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RPGRIP1Q96KN7 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RPGRIP1Q96KN7 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RPGRIP1Q96KN7 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RPGRIP1Q96KN7 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RPGRIP1Q96KN7 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RPGRIP1Q96KN7 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RPGRIP1Q96KN7 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RPGRIP1Q96KN7 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RPGRIP1Q96KN7 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RPGRIP1Q96KN7 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RPGRIP1Q96KN7 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RPGRIP1Q96KN7 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RPGRIP1Q96KN7 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RPGRIP1Q96KN7 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RPGRIP1Q96KN7 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
RPGRIP1Q96KN7 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
RPGRIP1Q96KN7 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RPGRIP1Q96KN7 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RPGRIP1Q96KN7 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RPGRIP1Q96KN7 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RPGRIP1Q96KN7 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RPGRIP1Q96KN7 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RPGRIP1Q96KN7 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RPGRIP1Q96KN7 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RPGRIP1Q96KN7 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RPGRIP1Q96KN7 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RPGRIP1Q96KN7 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RPGRIP1Q96KN7 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RPGRIP1Q96KN7 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RPGRIP1Q96KN7 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RPGRIP1Q96KN7 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RPGRIP1Q96KN7 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RPGRIP1Q96KN7 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RPGRIP1Q96KN7 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RPGRIP1Q96KN7 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RPGRIP1Q96KN7 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RPGRIP1Q96KN7 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RPGRIP1Q96KN7 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RPGRIP1Q96KN7 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RPGRIP1Q96KN7 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RPGRIP1Q96KN7 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RPGRIP1Q96KN7 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RPGRIP1Q96KN7 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RPGRIP1Q96KN7 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RPGRIP1Q96KN7 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RPGRIP1Q96KN7 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
RPGRIP1Q96KN7 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RPGRIP1Q96KN7 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RPGRIP1Q96KN7 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RPGRIP1Q96KN7 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RPGRIP1Q96KN7 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RPGRIP1Q96KN7 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RPGRIP1Q96KN7 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RPGRIP1Q96KN7 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms