Protein–RNA interactions for Protein: Q96H20

SNF8, Vacuolar-sorting protein SNF8, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNF8Q96H20 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNF8Q96H20 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNF8Q96H20 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SNF8Q96H20 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNF8Q96H20 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNF8Q96H20 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNF8Q96H20 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNF8Q96H20 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNF8Q96H20 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNF8Q96H20 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNF8Q96H20 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNF8Q96H20 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNF8Q96H20 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNF8Q96H20 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNF8Q96H20 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNF8Q96H20 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SNF8Q96H20 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.4
SNF8Q96H20 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SNF8Q96H20 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
SNF8Q96H20 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SNF8Q96H20 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SNF8Q96H20 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SNF8Q96H20 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SNF8Q96H20 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNF8Q96H20 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNF8Q96H20 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNF8Q96H20 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNF8Q96H20 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNF8Q96H20 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNF8Q96H20 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNF8Q96H20 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNF8Q96H20 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNF8Q96H20 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNF8Q96H20 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNF8Q96H20 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNF8Q96H20 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNF8Q96H20 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNF8Q96H20 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNF8Q96H20 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNF8Q96H20 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNF8Q96H20 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNF8Q96H20 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SNF8Q96H20 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SNF8Q96H20 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SNF8Q96H20 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SNF8Q96H20 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SNF8Q96H20 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SNF8Q96H20 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SNF8Q96H20 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SNF8Q96H20 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SNF8Q96H20 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SNF8Q96H20 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SNF8Q96H20 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SNF8Q96H20 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SNF8Q96H20 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SNF8Q96H20 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SNF8Q96H20 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SNF8Q96H20 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SNF8Q96H20 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNF8Q96H20 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNF8Q96H20 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SNF8Q96H20 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNF8Q96H20 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNF8Q96H20 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNF8Q96H20 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNF8Q96H20 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNF8Q96H20 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNF8Q96H20 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SNF8Q96H20 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SNF8Q96H20 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SNF8Q96H20 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SNF8Q96H20 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SNF8Q96H20 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
SNF8Q96H20 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNF8Q96H20 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNF8Q96H20 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNF8Q96H20 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNF8Q96H20 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNF8Q96H20 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNF8Q96H20 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNF8Q96H20 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNF8Q96H20 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SNF8Q96H20 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNF8Q96H20 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNF8Q96H20 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNF8Q96H20 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNF8Q96H20 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNF8Q96H20 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNF8Q96H20 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNF8Q96H20 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNF8Q96H20 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNF8Q96H20 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNF8Q96H20 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNF8Q96H20 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNF8Q96H20 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNF8Q96H20 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNF8Q96H20 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNF8Q96H20 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNF8Q96H20 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNF8Q96H20 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms