Protein–RNA interactions for Protein: Q96FV3

TSPAN17, Tetraspanin-17, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN17Q96FV3 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TSPAN17Q96FV3 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TSPAN17Q96FV3 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TSPAN17Q96FV3 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TSPAN17Q96FV3 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TSPAN17Q96FV3 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TSPAN17Q96FV3 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TSPAN17Q96FV3 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TSPAN17Q96FV3 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TSPAN17Q96FV3 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TSPAN17Q96FV3 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TSPAN17Q96FV3 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TSPAN17Q96FV3 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TSPAN17Q96FV3 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TSPAN17Q96FV3 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TSPAN17Q96FV3 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TSPAN17Q96FV3 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TSPAN17Q96FV3 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TSPAN17Q96FV3 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TSPAN17Q96FV3 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TSPAN17Q96FV3 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TSPAN17Q96FV3 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TSPAN17Q96FV3 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TSPAN17Q96FV3 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TSPAN17Q96FV3 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TSPAN17Q96FV3 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TSPAN17Q96FV3 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TSPAN17Q96FV3 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TSPAN17Q96FV3 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TSPAN17Q96FV3 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TSPAN17Q96FV3 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TSPAN17Q96FV3 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TSPAN17Q96FV3 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TSPAN17Q96FV3 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TSPAN17Q96FV3 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TSPAN17Q96FV3 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TSPAN17Q96FV3 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TSPAN17Q96FV3 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TSPAN17Q96FV3 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TSPAN17Q96FV3 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TSPAN17Q96FV3 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TSPAN17Q96FV3 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TSPAN17Q96FV3 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TSPAN17Q96FV3 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TSPAN17Q96FV3 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TSPAN17Q96FV3 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TSPAN17Q96FV3 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TSPAN17Q96FV3 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TSPAN17Q96FV3 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TSPAN17Q96FV3 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TSPAN17Q96FV3 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TSPAN17Q96FV3 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TSPAN17Q96FV3 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TSPAN17Q96FV3 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TSPAN17Q96FV3 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TSPAN17Q96FV3 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TSPAN17Q96FV3 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TSPAN17Q96FV3 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TSPAN17Q96FV3 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TSPAN17Q96FV3 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TSPAN17Q96FV3 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TSPAN17Q96FV3 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TSPAN17Q96FV3 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TSPAN17Q96FV3 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TSPAN17Q96FV3 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TSPAN17Q96FV3 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TSPAN17Q96FV3 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TSPAN17Q96FV3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TSPAN17Q96FV3 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TSPAN17Q96FV3 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TSPAN17Q96FV3 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TSPAN17Q96FV3 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TSPAN17Q96FV3 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TSPAN17Q96FV3 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TSPAN17Q96FV3 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TSPAN17Q96FV3 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TSPAN17Q96FV3 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TSPAN17Q96FV3 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TSPAN17Q96FV3 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TSPAN17Q96FV3 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TSPAN17Q96FV3 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TSPAN17Q96FV3 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TSPAN17Q96FV3 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TSPAN17Q96FV3 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TSPAN17Q96FV3 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TSPAN17Q96FV3 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TSPAN17Q96FV3 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSPAN17Q96FV3 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSPAN17Q96FV3 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSPAN17Q96FV3 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSPAN17Q96FV3 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSPAN17Q96FV3 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TSPAN17Q96FV3 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TSPAN17Q96FV3 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TSPAN17Q96FV3 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TSPAN17Q96FV3 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TSPAN17Q96FV3 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TSPAN17Q96FV3 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TSPAN17Q96FV3 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TSPAN17Q96FV3 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 189.1 ms