Protein–RNA interactions for Protein: Q96C10

DHX58, Probable ATP-dependent RNA helicase DHX58, humanhuman

Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX58Q96C10 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
DHX58Q96C10 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
DHX58Q96C10 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
DHX58Q96C10 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
DHX58Q96C10 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
DHX58Q96C10 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
DHX58Q96C10 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
DHX58Q96C10 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
DHX58Q96C10 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
DHX58Q96C10 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
DHX58Q96C10 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
DHX58Q96C10 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
DHX58Q96C10 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
DHX58Q96C10 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
DHX58Q96C10 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
DHX58Q96C10 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
DHX58Q96C10 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
DHX58Q96C10 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
DHX58Q96C10 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
DHX58Q96C10 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
DHX58Q96C10 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.77
DHX58Q96C10 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
DHX58Q96C10 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
DHX58Q96C10 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
DHX58Q96C10 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
DHX58Q96C10 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
DHX58Q96C10 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
DHX58Q96C10 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
DHX58Q96C10 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
DHX58Q96C10 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
DHX58Q96C10 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
DHX58Q96C10 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
DHX58Q96C10 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
DHX58Q96C10 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
DHX58Q96C10 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
DHX58Q96C10 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
DHX58Q96C10 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
DHX58Q96C10 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
DHX58Q96C10 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
DHX58Q96C10 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
DHX58Q96C10 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
DHX58Q96C10 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
DHX58Q96C10 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
DHX58Q96C10 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
DHX58Q96C10 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
DHX58Q96C10 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
DHX58Q96C10 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
DHX58Q96C10 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
DHX58Q96C10 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
DHX58Q96C10 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
DHX58Q96C10 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
DHX58Q96C10 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
DHX58Q96C10 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
DHX58Q96C10 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
DHX58Q96C10 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
DHX58Q96C10 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
DHX58Q96C10 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
DHX58Q96C10 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
DHX58Q96C10 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
DHX58Q96C10 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
DHX58Q96C10 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
DHX58Q96C10 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
DHX58Q96C10 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
DHX58Q96C10 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
DHX58Q96C10 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
DHX58Q96C10 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
DHX58Q96C10 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
DHX58Q96C10 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
DHX58Q96C10 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
DHX58Q96C10 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
DHX58Q96C10 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
DHX58Q96C10 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
DHX58Q96C10 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
DHX58Q96C10 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
DHX58Q96C10 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
DHX58Q96C10 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
DHX58Q96C10 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
DHX58Q96C10 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
DHX58Q96C10 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
DHX58Q96C10 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
DHX58Q96C10 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
DHX58Q96C10 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
DHX58Q96C10 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
DHX58Q96C10 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
DHX58Q96C10 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
DHX58Q96C10 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
DHX58Q96C10 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
DHX58Q96C10 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
DHX58Q96C10 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
DHX58Q96C10 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
DHX58Q96C10 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
DHX58Q96C10 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
DHX58Q96C10 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
DHX58Q96C10 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
DHX58Q96C10 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
DHX58Q96C10 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
DHX58Q96C10 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
DHX58Q96C10 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
DHX58Q96C10 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
DHX58Q96C10 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms